In een kiemcentrum, een structuur die ongeveer een week na het begin van een afweerreactie in een lymfeknoop ontstaat, voeren geactiveerde B-cellen een evolutionair algoritme uit. In de donkere zone delen zij elke zes uur en worden hun variabele antilichaamgenen door het enzym AID gemuteerd met ongeveer één verandering per duizend baseparen per deling — somatische hypermutatie, een miljoen maal het tempo van het genoom, gericht op één kilobase. In de lichte zone toetst elke cel haar nieuwe receptor aan antigeen dat op folliculaire dendritische cellen wordt vastgehouden, en wedijvert zij om de hulp van T-cellen: cellen die beter binden nemen meer antigeen op, presenteren meer, ontvangen meer hulp en keren naar de donkere zone terug om opnieuw te delen; cellen die slechter binden, of hun binding hebben verloren, sterven door apoptose. In twee tot drie weken van zulke cycli stijgt de affiniteit van de overlevende antilichamen honderd- tot duizendvoudig — affiniteitsrijping — en de winnaars vertrekken als plasmacellen en geheugencellen, ook nog van klasse gewisseld. De secundaire afweerreactie is sneller, groter en van beter antilichaam gemaakt omdat zij bij deze geselecteerde, uitgebreide, gewisselde populatie begint.
Voorbeelden
Voorbeeld 16.7 (Kinetiek van een afweerreactie)
Ongeveer één B-cel op bindt een gegeven epitoop, dus bevatten de B-cellen van een lichaam zo’n voorlopers, waarvan er misschien honderd het antigeen in de afvoerende lymfeknoop ontmoeten. Bij een deling elke acht uur worden honderd cellen in een week . Antilichaam verschijnt na vier tot zes dagen in het serum, IgM het eerst, piekt na ongeveer twee weken en daalt voor IgG met een halveringstijd van drie weken naarmate de kortlevende plasmacellen sterven, tot op het niveau dat de langlevende plasmacellen van het merg jarenlang in stand houden. Een tweede blootstelling begint bij – geheugencellen met hoge affiniteit die al naar IgG zijn gewisseld: het antilichaam stijgt binnen twee dagen, tien- tot honderdvoudig hoger, en neutraliseert de ziekteverwekker voordat die zich kan vestigen — en dat is wat een vaccin oplevert.