الجزيئات العضوية في الخلية هياكل كربونية تحمل مجموعة صغيرة من الزمر الوظيفية تحدد كيمياءها:
| الزمرة | الصيغة | الخاصية | توجد في |
|---|---|---|---|
| هيدروكسيل | قطبية، تعقد روابط هيدروجينية | السكريات، الكحولات | |
| كربونيل | قطبية، فعالة | الألدوزات، الكيتوزات | |
| كربوكسيل | حمضية (p) | الحموض الدسمة، الحموض الأمينية | |
| أميني | أساسية (p) | الحموض الأمينية | |
| فوسفات | مشحونة، روابط غنية بالطاقة | النوكليوتيدات، ATP | |
| سلفهيدريل | تعقد جسور S–S | السيستئين | |
| ميثيل | غير قطبية | الدهون، وسمات DNA |
وعند pH الخلية تكون زمر الكربوكسيل مشرَّدة () وزمر الأمين مبرتنة ().