Qu'est-ce que « Structure secondaire » ?

La structure secondaire d’une protéine est le repliement local et régulier de son squelette, tenu par des liaisons hydrogène entre les groupes C=O et N–H du squelette. Deux motifs dominent. L’hélice $\alpha$ : une spirale droite de 3.6 résidus par tour, s’élevant de $0.15\,\mathrm{nm}$ par résidu ($0.54\,\mathrm{nm}$ par tour), chaque C=O étant lié au N–H situé quatre résidus plus loin, les chaînes latérales pointant vers l’extérieur. Le feuillet $\beta$ : des chaînes presque entièrement étirées ($0.35\,\mathrm{nm}$ par résidu) et disposées côte à côte, parallèles ou antiparallèles, liées entre brins voisins, les chaînes latérales alternant au-dessus et au-dessous du feuillet. Entre eux, des coudes et des boucles inversent le sens de la chaîne. La proline, dont le cycle bloque $\phi$, brise les hélices ; la glycine, sans chaîne latérale, permet des coudes qu’aucun autre résidu ne peut faire.