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जीवविज्ञान · शब्दावली

द्वितीयक संरचना क्या है?

अन्य नाम: alpha helix · beta sheet

परिभाषा 12.5 विश्वविद्यालय जीवविज्ञान — वर्ष 1 · अध्याय 12 — ऐमीनो अम्ल और प्रोटीन

किसी प्रोटीन की द्वितीयक संरचना उसकी रीढ़ का वह स्थानीय, नियमित वलन है जिसे रीढ़ के C=O और N–H समूहों के बीच के हाइड्रोजन बंध थामते हैं। दो प्रतिरूप छाए हुए हैं। α\alpha कुंडली: प्रति फेरा 3.6 अवशेषों की एक दक्षिणावर्त कुंडली, जो प्रति अवशेष 0.15nm0.15\,\mathrm{nm} चढ़ती है (प्रति फेरा 0.54nm0.54\,\mathrm{nm}), और जिसका हर C=O चार अवशेष आगे वाले N–H से बँधा है, तथा पार्श्व शृंखलाएँ बाहर की ओर संकेत करती हैं। β\beta पट्ट: शृंखलाएँ लगभग पूरी तनी हुई (प्रति अवशेष 0.35nm0.35\,\mathrm{nm}) और अगल-बगल बिछी हुई, समांतर या प्रतिसमांतर, पड़ोसी लड़ियों के बीच बँधी, और पार्श्व शृंखलाएँ पट्ट के ऊपर तथा नीचे एकांतर में। इनके बीच मोड़ और फंदे शृंखला की दिशा उलट देते हैं। प्रोलीन, जिसका वलय ϕ\phi को जकड़ देता है, कुंडलियाँ तोड़ता है; और ग्लाइसीन, जिसकी कोई पार्श्व शृंखला नहीं, ऐसे मोड़ बनने देता है जो कोई और अवशेष नहीं बना सकता।

रामचंद्रन आलेख:  और  के वे संयोजन जो कोई अवशेष अपना सकता है। दो बड़े अनुमत क्षेत्र  पट्ट और दक्षिणावर्त  कुंडली के हैं; और तल का अधिकांश भाग परमाणुओं की टक्करों से वर्जित है।
रामचंद्रन आलेख: ϕ\phi और ψ\psi के वे संयोजन जो कोई अवशेष अपना सकता है। दो बड़े अनुमत क्षेत्र β\beta पट्ट और दक्षिणावर्त α\alpha कुंडली के हैं; और तल का अधिकांश भाग परमाणुओं की टक्करों से वर्जित है।
लाइनस पॉलिंग (1901–1994), जिन्होंने पेप्टाइड बंध की समतलता और हाइड्रोजन बंधों की ज्यामिति से 1951 में  कुंडली तथा  पट्ट निकाल लिए, इससे पहले कि इनमें से कोई किसी प्रोटीन में देखा गया हो। छायाचित्र: नोबेल फ़ाउंडेशन, 1962, सार्वजनिक अधिकार-मुक्त।
लाइनस पॉलिंग (1901–1994), जिन्होंने पेप्टाइड बंध की समतलता और हाइड्रोजन बंधों की ज्यामिति से 1951 में α\alpha कुंडली तथा β\beta पट्ट निकाल लिए, इससे पहले कि इनमें से कोई किसी प्रोटीन में देखा गया हो। छायाचित्र: नोबेल फ़ाउंडेशन, 1962, सार्वजनिक अधिकार-मुक्त।

उदाहरण

उदाहरण 12.6 (संख्याओं में कुंडली और पट्ट)

झिल्ली पार करती किसी α\alpha कुंडली को 3nm3\,\mathrm{nm} का जलविरागी अंतर्भाग पार करना पड़ता है: 3/0.15=203/0.15 = 20 अवशेष, और सचमुच अध्याय 7 के अंतःझिल्ली खंड लगभग बीस जलविरागी अवशेषों की लड़ियाँ हैं। उतनी ही लंबाई की कोई β\beta लड़ी 7nm7\,\mathrm{nm} तक फैलती है: रेशम का फ़ाइब्रोइन ग्लाइसीन और ऐलानीन के चिने हुए प्रतिसमांतर पट्ट है, और रेशम का धागा उतने ही भार के इस्पात से अधिक मज़बूत है, क्योंकि सहसंयोजी रीढ़ें तंतु की दिशा में ही लेटी हैं।

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