جميع الكتب
حول المدرب تسجيل الدخول ابدأ القراءة

الأحياء · المسرد

ما معنى البنية الثانوية؟

يُعرف أيضًا باسم: بنية ثانوية · alpha · beta

تعريف 12.5 الأحياء الجامعية — السنة الأولى · الفصل 12 — الحموض الأمينية والبروتينات

البنية الثانوية لبروتين هي الطي الموضعي المنتظم لهيكله، وتمسكه روابط هيدروجينية بين زمر C=O وN–H في الهيكل. ونمطان يسيطران. اللولب α\alpha: وهو ملف يميني من 3.6 بقية في الدورة، يرتفع 0.15nm0.15\,\mathrm{nm} لكل بقية (0.54nm0.54\,\mathrm{nm} لكل دورة)، وكل زمرة C=O مرتبطة بزمرة N–H على بعد أربع بقايا أمامها، والسلاسل الجانبية تشير إلى الخارج. والصفيحة β\beta: وهي سلاسل ممدودة شبه تام (0.35nm0.35\,\mathrm{nm} لكل بقية) موضوعة جنبًا إلى جنب، متوازية أو متعاكسة، مرتبطة بين الخصلات المتجاورة، وسلاسلها الجانبية تتناوب فوق الصفيحة وتحتها. وبينهما انعطافات وعرى تعكس اتجاه السلسلة. والبرولين، الذي تحبس حلقته ϕ\phi، يكسر اللوالب؛ والغليسين، ولا سلسلة جانبية له، يتيح انعطافات لا تستطيعها بقية أخرى.

مخطط راماتشاندران: تراكيب  و التي تستطيع بقية أن تتخذها. ومنطقتان واسعتان مسموحتان تقابلان الصفيحة  واللولب  اليميني؛ ومعظم المستوي ممنوع بتصادمات بين الذرات.
مخطط راماتشاندران: تراكيب ϕ\phi وψ\psi التي تستطيع بقية أن تتخذها. ومنطقتان واسعتان مسموحتان تقابلان الصفيحة β\beta واللولب α\alpha اليميني؛ ومعظم المستوي ممنوع بتصادمات بين الذرات.
لينوس باولنغ (1901–1994)، الذي استنتج اللولب  والصفيحة  سنة 1951 من استواء الرابطة الببتيدية وهندسة الروابط الهيدروجينية، قبل أن يُرى أي منهما في بروتين. الصورة: Nobel Foundation، 1962، ملك عام.
لينوس باولنغ (1901–1994)، الذي استنتج اللولب α\alpha والصفيحة β\beta سنة 1951 من استواء الرابطة الببتيدية وهندسة الروابط الهيدروجينية، قبل أن يُرى أي منهما في بروتين. الصورة: Nobel Foundation، 1962، ملك عام.

أمثلة

مثال 12.6 (اللولب والصفيحة بالأرقام)

اللولب α\alpha العابر للغشاء عليه أن يقطع 3nm3\,\mathrm{nm} من اللب الكاره للماء: أي 3/0.15=203/0.15 = 20 بقية، وبالفعل فإن المقاطع العابرة للغشاء في الفصل 7 مسالك من نحو عشرين بقية كارهة للماء. أما خصلة β\beta بالطول نفسه فتمتد 7nm7\,\mathrm{nm}: وفيبروين الحرير صفائح متعاكسة مكدسة من الغليسين والألانين، وخيط الحرير أقوى من فولاذ بوزنه لأن الهياكل التساهمية تمتد على امتداد الليف.

اقرأ في الفصل ←