द्वितीयक संरचना কী?

किसी प्रोटीन की द्वितीयक संरचना उसकी रीढ़ का वह स्थानीय, नियमित वलन है जिसे रीढ़ के C=O और N–H समूहों के बीच के हाइड्रोजन बंध थामते हैं। दो प्रतिरूप छाए हुए हैं। $\alpha$ कुंडली: प्रति फेरा 3.6 अवशेषों की एक दक्षिणावर्त कुंडली, जो प्रति अवशेष $0.15\,\mathrm{nm}$ चढ़ती है (प्रति फेरा $0.54\,\mathrm{nm}$), और जिसका हर C=O चार अवशेष आगे वाले N–H से बँधा है, तथा पार्श्व शृंखलाएँ बाहर की ओर संकेत करती हैं। $\beta$ पट्ट: शृंखलाएँ लगभग पूरी तनी हुई (प्रति अवशेष $0.35\,\mathrm{nm}$) और अगल-बगल बिछी हुई, समांतर या प्रतिसमांतर, पड़ोसी लड़ियों के बीच बँधी, और पार्श्व शृंखलाएँ पट्ट के ऊपर तथा नीचे एकांतर में। इनके बीच मोड़ और फंदे शृंखला की दिशा उलट देते हैं। प्रोलीन, जिसका वलय $\phi$ को जकड़ देता है, कुंडलियाँ तोड़ता है; और ग्लाइसीन, जिसकी कोई पार्श्व शृंखला नहीं, ऐसे मोड़ बनने देता है जो कोई और अवशेष नहीं बना सकता।