الأحياء الجامعية — السنة الثالثة · Bachelor Year 3
12علم الجراثيم: النمو والفيزيولوجيا والوراثة
خلية واحدة من Escherichia coli في مرق دافئ تنقسم كل عشرين دقيقة. ولو تُركت من غير كابح لفاقت ذريتها الأرضَ وزنًا في يومين؛ لكنها تتوقف في الواقع في ساعات، حين ينفد السكر، وتقعد أسابيع في حالة تنجو من الجوع. وبكتيريا قريبة، إذا أُعطيت جرحًا وبضع ساعات، تصير مئة مليون خلية وحمّى؛ وقبل مئة سنة كانت تقتل ثلث المرضى الذين تخمجهم، ومنذ عام 1941 أنقذ سمّ عفن ضدها أرواحًا أكثر من أي دواء آخر — بينما طوّرت البكتيريا، على مدى الثمانين سنة نفسها، سبلًا للالتفاف على كل مضاد حيوي صُنع. وقد كانت البكتيريا الكائنات التي بُيّن فيها أول مرة أن المورّثات DNA، وفُهم فيها التنظيم المورّثي أول مرة، ومنها أُخذت أدوات الفصل 6. ويتناولها هذا الفصل بوصفها كائنات: غلافها، وحساب نموها في دورق وفي مزرعة مستمرة، وكيف تستشعر جمهرتها كثافتها هي، وحركة المورّثات بين الخلايا، وكيمياء المضادات الحيوية والمقاومة وتطورها.
12.1 الخلية البكتيرية
تعريف 12.1 (الغلاف)
كل بكتيريا إلا قليلًا محاطة بجدار من الببتيدوغليكان: سلاسل من N-أستيل غلوكوزامين وحمض N-أستيل موراميك بالتناوب، مشبَّكة بببتيدات قصيرة في جزيء واحد يحيط بالخلية ويقاوم ضغط الامتلاء — وهو عدة جوّات — في الهيولى. والبكتيريا إيجابية الغرام لها جدار ثخين من ، بطبقات كثيرة، تتخلله حموض التيكويك؛ والبكتيريا سلبية الغرام لها جدار رقيق من طبقة أو طبقتين وخارجه طبقة دهنية ثنائية ثانية هي الغشاء الخارجي، ووريقته الخارجية عديد سكريد شحمي (LPS، وهو الذيفان الداخلي — الجزيء الذي تتعرفه المناعة الفطرية في الفصل 15 والذي يسبب الصدمة الإنتانية)، محيطًا بالمحيط حول البلازما. والبورينات في الغشاء الخارجي تُدخل الجزيئات الصغيرة وتستبعد كثيرًا من المضادات الحيوية. وقد تقع في الخارج محفظة من عديد السكريد تقي من البلعميات، وأسواط للسباحة (الفصل 9)، وأهلاب للالتصاق و الاقتران. وفي الداخل يُطوى الصبغي — وهو جزيء حلقي واحد من في معظم الأنواع — في نُوَيد بلا غشاء، بجانب البلازميدات. وبعض الأجناس (Bacillus، و Clostridium) يستطيع أن يحبس نسخة من الصبغي في غلاف ثخين بوغًا داخليًا، مجففًا خامل الاستقلاب، ينجو من الغليان والإشعاع وقرون من الجفاف وينبت حين تعود المغذيات.
طريقة 12.2 (صبغة غرام)
أقدم اختبار في مختبر الجراثيم (غرام، 1884) ما يزال يقرر أول اختيار لمضاد حيوي. (1) الطخ العينة وثبّتها بالحرارة؛ (2) اصبغ بالبنفسجي البلوري، ثم باليود، الذي يكوّن معقّدًا كبيرًا غير ذواب مع الصبغ داخل الخلايا؛ (3) اغسل بالكحول: فالببتيدوغليكان الثخين في إيجابيات الغرام، وقد جففه الكحول، يحبس المعقّد فتبقى الخلايا بنفسجية، بينما يدع الجدار الرقيق في سلبيات الغرام المعقّدَ يخرج؛ (4) اصبغ صبغة مضادة بالسافرانين، التي تلوّن سلبيات الغرام، وقد صارت عديمة اللون، بالوردي. والشكل والترتيب — مكورات في عناقيد (عنقوديات) أو في سلاسل (عقديات)، وعصيات، ولولبيات — تضيّق التعرف أكثر، والمكور البنفسجي في عناقيد من خُراج عنقودية قبل أن تنمو أي مزرعة.
12.2 النمو
مبرهنة 12.3 (النمو الأسّي وقانون مونو والمزرعة الكيميائية المستقرة)
جمهرة من خلية تنقسم بزمن جيل تنمو بحسب بمعدل نمو نوعي . ويتوقف المعدل على المغذي المحدِّد بحسب قانون مونو
وهو يتشبع عند ويبلغ نصف أقصاه عند . وفي المزرعة الكيميائية المستقرة — وهي وعاء حجمه يدخله وسط طازج تركيز مغذيه بمعدل ، وتخرج منه المزرعة بالمعدل نفسه، ومعدل التمديد — تكون الحالة المستقرة
حيث كثافة الخلايا و الغلة (أي الخلايا المصنوعة لكل وحدة من المغذي). فالمجرّب يضبط معدل النمو بإدارة مضخة؛ والمزرعة تستجيب بضبط المغذي الذي تتركه خلفها. وإذا تجاوزت القيمة عجزت الخلايا عن مواكبتها وغُسلت خارجًا.
برهان. الخلايا: ، أي النمو ناقص الخروج؛ وعند الحالة المستقرة مع ، يكون ، وقلبُ قانون مونو يعطي . والمغذي: ، أي الدخول ناقص الخروج ناقص الاستهلاك؛ وعند الحالة المستقرة، مع ، يكون ، ومنه . ولا توجد الحالة المستقرة إلا إذا كانت ، أي ؛ وبعد ذلك تكون الحالة المستقرة الوحيدة ، أي الغسل. والاستقرار: فإذا ارتفعت فوق استهلكت أكثر، فهبطت دون ، وهبطت دون وتناقصت — أي تغذية راجعة سالبة عبر المغذي. ∎
مثال 12.4 (مزرعة بالأرقام)
E. coli في وسط غني عند : ، و. فمن خلية واحدة، بعد اثنتي عشرة ساعة — أي خلية، ونحو ، وهو حيث يتوقف دورق سعته لنفاد الأكسجين والسكر؛ و“كتلة الأرض في يومين” هي خلية، و الحساب لا يبيّن إلا أن النمو الأسّي لا يدوم أبدًا. وفي مزرعة كيميائية على الغلوكوز عند ، و، و، و من الخلايا لكل غرام غلوكوز، يترك معدل تمديد قدره قيمة من الغلوكوز ويحفظ من الخلايا، تنقسم كل ، بلا حد. والمزرعة الكيميائية المستقرة هي كيف تُدرس فيزيولوجيا معدل نمو ثابت، وكيف تُجرى آلاف الأجيال من التطور في قنينة.
تعريف 12.5 (الأطوار والحالات)
في دورق طازج (وهي مزرعة الدفعة) تتوقف الخلايا أولًا — وهو طور التلكؤ، ريثما تحرّض الإنزيمات التي يحتاجها الوسط الجديد — ثم تنمو أسّيًا، ثم تتوقف حين ينفد مغذٍّ أو تتراكم فضلة: وهو الطور الثابت، تنكمش فيه الخلايا، و تثخّن غلافها، وتكثّف نُوَيدها حول بروتينات واقية، وتفتح مورّثات الكرب عبر عامل سيغما البديل RpoS، وتستطيع أن تبقى شهورًا؛ ويتبعه طور موت تنحل فيه معظم الخلايا ويعيش قليل منها على البقايا. وبعض الأنواع يجيب عن الجوع ببرنامج تطوري: فالنوع Bacillus subtilis ينقسم انقسامًا غير متناظر وتبتلع الخلية الأكبر الأصغر وتبني البوغ حولها، في تسلسل من ثماني ساعات يتحكم فيه شلال من عوامل سيغما — وهي الوحدات التي توجّه بوليميراز RNA إلى طقم من المروّجات — بالتناوب بين المقصورتين، وهو أول مثال بكتيري على التمايز وعلى الإشارة بين خلية وأخرى عبر جدار.
12.3 استشعار بعضها بعضًا
تعريف 12.6 (استشعار النصاب)
تكشف البكتيريا كثافتها هي عبر استشعار النصاب: فكل خلية تفرز جزيء إشارة صغيرًا، وهو محرّض ذاتي — لاكتونات الهوموسيرين المؤسترة في سلبيات الغرام، وببتيدات قصيرة في إيجابيات الغرام — بمعدل ثابت؛ ويرتفع التركيز في الوسط مع عدد الخلايا، فإذا تجاوز عتبةً ارتبط بمستقبل يفتح طقمًا من المورّثات، منها سينثاز المحرّض الذاتي نفسه (ومن هنا الاسم). والمورّثات المتحكَّم فيها هكذا هي التي لا تفيد إلا في جماعة: كالضوء في Vibrio fischeri، وعوامل الفوعة في Staphylococcus aureus و Pseudomonas aeruginosa، وحشوة الغشاء الحيوي، والكفاءة لالتقاط DNA، وقتل الجيران. ومعظم استشعار البكتيريا يجري عبر منظومات ثنائية المكوّن: كيناز هستيديني غشائي يكشف منبّهًا ويفسفر منظّم استجابة هيوليًا، يرتبط بجزيء DNA — ولدى الخلية عشرات منها، للفوسفات، والأسمولية، و الأكسجين، ومحرّضات الأنواع الأخرى.
شواهد. نمّى نيلسون وبلات وهاستنغز (1970) البكتيريا البحرية المضيئة Vibrio fischeri من لقاح ممدَّد فوجدوا أن الخلايا لا تصنع ضوءًا حتى تبلغ كثافة قدرها نحو في المليلتر، ثم تضيء كلها معًا؛ وأن وسطًا نمت فيه مزرعة كثيفة، ثم عُقّم وأُضيف إلى مزرعة ممددة، فتح الضوء فورًا. فالخلايا كانت تعدّ مادة مفرَزة، لا زمنًا ولا مغذيًا. وحُدّدت المادة لاكتون أسيل هوموسيرين (إبرهارد، 1981)، واستُنسخت المورّثات — luxI للسينثاز، و luxR للمستقبل، وأوبرون اللوسيفيراز الذي تتحكم فيه — في E. coli، فصارت تتوهج حين تزدحم. وفي الحبار الذي يؤوي البكتيريا عند في المليلتر، يضيء عضو الضوء؛ وفي البحر، حيث تكون البكتيريا ممددة، تكون مظلمة وتوفّر الكلفة. ∎
قضية 12.7 (عتبة كثافة)
لتفرز كل خلية من خلية في حجم محرّضًا ذاتيًا بمعدل جزيء في الثانية، وليُفقد الجزيء (بالتحلل أو التمديد) بمعدل من الرتبة الأولى . عندئذٍ يقترب التركيز من ، متناسبًا مع كثافة الخلايا ، بثابت زمن ؛ ويُفتح المستقبل حين تبلغ عتبته ، أي عند الكثافة
وفي حيز مغلق — كعضو ضوء حبار، أو خُراج، أو مخاط رئة — تكون صغيرة لأن الإشارة لا تُحمل بعيدًا، فتُبلغ الكثافة العتبية بخلايا أقل؛ وفي الماء المفتوح لا تُبلغ أبدًا. فالخلية تقيس إذن لا عددها بل عددها لكل وحدة من الحجم الذي تشارك فيه، وهو ما يهم في أي فعل تعاوني، والتغذية الراجعة الموجبة للمحرّض الذاتي على سينثازه هو تجعل المفتاح حادًا: فمتى تجاوزت بضع خلايا العتبة، دفع ناتجها الزائد البقيةَ فوقها.
برهان. لها الحالة المستقرة وتسترخي إليها مثل . ووضعُ والحل من أجل يعطي الكثافة العتبية. ∎
12.4 حركة المورّثات
تعريف 12.8 (النقل الأفقي للمورّثات)
تتكاثر البكتيريا نسيليًا لكنها تتبادل المورّثات بثلاثة طرق. التحول: التقاط DNA عارٍ من البيئة بخلية كفؤة — وهو الطريق الذي اكتسبت به مكورات غريفيث الرئوية محفظتها وبيّن به آفري أن مبدأ التحول DNA (1944). والنقل بالعاثيات: عاثية تحزم قطعة من DNA المضيف وتحقنها في المضيف التالي (الفصل 13). والاقتران: نقل بلازميد عبر هلب وجسر تزاوج من مانح يحمله إلى متلقٍّ، وقد بيّنه ليدربرغ وتاتوم (1946) بسلالات معوزة من E. coli لم تعط مؤتلفات مكتفية إلا حين خُلطت. والبلازميدات الاقترانية تحمل مورّثات نقلها هي؛ وكثير منها يحمل أيضًا مورّثات مقاومة، متجمعة غالبًا في الإنتغرونات ومحفوفة بعناصر قافزة، حتى إن تزاوجًا واحدًا يستطيع أن ينقل مقاومة خمسة مضادات حيوية دفعةً واحدة، عبر الأنواع. والنتيجة أن للنوع البكتيري جينومًا لبّيًا تشترك فيه السلالات كلها وجينومًا ملحقًا متغيرًا — وهو الجينوم الشامل: فقد تختلف سلالتان من E. coli في خمس مورّثاتهما، وتختلف السلالات الممرضة عن غير الضارة أساسًا بجزر فوعة مكتسبة. ومورّثات فصل الطفرات في كتاب السنة الثانية تنشأ بالطفرة؛ أما مورّثات هذا الفصل فتصل في معظمها وصولًا.
شواهد. أثبت روبرت كوخ (1876–1884) أن بكتيريا بعينها تسبب مرضًا بعينه: فعزل Bacillus anthracis من حيوانات مريضة، ونمّاها مزرعةً نقية على وسط صلب (وطبق الأغار و المستعمرة المفردة من ابتكارات مختبره)، وبيّن أن المزرعة تعيد إنتاج الجمرة الخبيثة في حيوانات سليمة ويمكن إعادة عزلها منها — وهي المسلّمات التي ما تزال تعرّف الممرض — ثم مضى إلى عصية السل وضمة الكوليرا. ولاحظ ألكسندر فلمنغ (1928) أن عفنًا لوّث طبقًا من العنقوديات كان قد صفّى منطقة حوله؛ ونُقّيت المادة، وهي البنسلين، وبيّن فلوري وتشين (1940–1941) أنها تشفي الأخماج، و في غضون عقد شاعت في المستشفيات عنقوديات مقاومة تحمل إنزيمًا يهدم البنسلين — وهو تحذير أطلقه فلمنغ نفسه في محاضرة نوبل. ∎
12.5 المضادات الحيوية والمقاومة
تعريف 12.9 (المضادات الحيوية)
المضاد الحيوي جزيء يقتل البكتيريا أو يوقف نموها عند تراكيز لا تضر المضيف، بعمله على هدف يخلو منه المضيف أو يملكه بصورة مختلفة — وهي السمية الانتقائية. والأهداف قليلة. فجدار الخلية: -اللاكتامات (البنسلينات، والسيفالوسبورينات، والكاربابينيمات) تحاكي طرف D-Ala-D-Ala في ببتيد الببتيدوغليكان وتؤستل الإنزيمات التي تشبّكه، فيكون الجدار النامي ضعيفًا وتنفجر الخلية تحت امتلائها؛ والفانكوميسين يربط D-Ala-D-Ala نفسه. و الريبوزوم، وصورته البكتيرية تختلف عن صورة حقيقيات النوى: فالأمينوغليكوزيدات (الوحدة الصغيرة، فتسبب سوء القراءة)، والتتراسيكلينات (بحجب دخول tRNA)، والماكروليدات والكلورامفينيكول (نفق خروج الوحدة الكبيرة وناقلة الببتيديل). وجيراز DNA والتوبوإيزوميراز IV: الكينولونات. وبوليميراز RNA: الريفامبيسين. واصطناع الفولات، وهو ما لا تفعله الحيوانات: السلفوناميدات والتريميثوبريم. والغشاء: البوليميكسينات، وهي الملاذ الأخير. وأدنى تركيز مثبط (MIC) هو أخفض تركيز من دواء يمنع نموًا مرئيًا لسلالة؛ وتُسمى السلالة مقاومة حين يتجاوز MIC عندها التركيزَ الذي يبلغه الدواء في المريض.
طريقة 12.10 (قياس الحساسية)
اختباران. تمديد المرق: لقّح عددًا ثابتًا من الخلايا (نحو في المليلتر) في صف من الأنابيب أو الحفر تحوي المضاد الحيوي بخطوات مضاعفة، وحضّن ليلةً، و اقرأ أول حفرة صافية: فذلك التركيز هو MIC. وانتشار الأقراص: انشر السلالة على طبق أغار، وضع أقراصًا ورقية محمَّلة بمقادير معلومة من عدة مضادات حيوية، وحضّن؛ فينتشر الدواء خارجًا، ويهبط تركيزه مع المسافة، ويُثبَّط النمو حتى نصف القطر الذي يساوي عنده التركيز MIC، فيعطي قطر المنطقة الصافية — مقروءًا في جداول معايرة — الحساسيةَ لكل قرص على طبق واحد. وكلا الاختبارين يستغرق يومًا؛ و تسلسلُ الجينوم بحثًا عن مورّثات مقاومة معروفة وطفراتها يستغرق اليوم نفسه وقد بدأ يحل محلهما.
تعريف 12.11 (المقاومة)
تقاوم البكتيريا مضادًا حيويًا بواحد من خمسة سبل. فهي تهدم الدواء: إذ تحلمه -اللاكتامازات حلقة -اللاكتام، و الصور واسعة الطيف والكاربابينيمازية تهدم اليوم أحدثها. وتبدّل الهدف: بطفرة في البروتين الريبوزومي أو في الجيراز الذي يربطه الدواء، أو، في MRSA (وهي العنقودية Staphylococcus aureus المقاومة للميثيسيلين)، بمورّثة مكتسبة لإنزيم تشبيك لا ترتبط به -اللاكتامات؛ ومقاومة الفانكوميسين تستبدل بطرف D-Ala طرفَ D-lactate، الذي لا يتعرفه الدواء. وتضخّ الدواء خارجًا عبر مضخات النَّفْث، وهي عريضة النوعية غالبًا. وتمنع الدواء من الدخول، بفقد بورين. أو تلتف على الخطوة المحجوبة بإنزيم بديل. وطفرات الهدف تنشأ مصادفةً في المريض بمعدلات إلى لكل انقسام ويُنتقى لها أثناء العلاج؛ أما الإنزيمات والمضخات فتُكتسب في معظمها على بلازميدات من المخزون الهائل في بكتيريا التربة والأمعاء، التي تطورت فيها على مر العصور ضد المضادات الحيوية التي تصنعها الفطور وبكتيريا أخرى. أما المعنِّدات — وهي خلايا ساكنة تنجو من دواء بلا مقاومة وراثية — فتفسّر الانتكاسات بعد علاج كان ينبغي أن ينجح.
قضية 12.12 (لماذا تكون المقاومة حتمية ولماذا تكون التوليفة هي الجواب)
الخمج من خلية المعالَج بدواء تنشأ ضده طفرات مقاومة بمعدل لكل انقسام يحوي سلفًا نحو عشر خلايا مقاومة؛ فيقتل الدواء البقية وتستولي العشر — وهو حساب الفصل 11 بعينه، إذ إن جمهرة بكتيرية وورمًا كليهما نسيلة تتطور تحت الانتقاء. أما دواءان بهدفين مستقلين فيواجهان خلية مقاومة لكليهما بمعدل لكل انقسام، وهو ما لا يحويه مليار خلية. ولهذا عُولج السل، وآفاته تحوي – عصية، بثلاثة أو أربعة أدوية دفعةً واحدة منذ خمسينيات القرن العشرين، ولهذا أنتج علاجه بدواء واحد مقاومة في أشهر؛ ولهذا أيضًا ينتقي كل استعمال لمضاد حيوي، على مريض أو في مِعلف، مقاومةً في مكان ما، ولهذا يكون معدل المضادات الحيوية الجديدة — ولا واحد من صنف جديد ضد سلبيات الغرام منذ ستينيات القرن العشرين — هو المقياس الذي تُعدّ في مواجهته الخسائر. والعلاج هو علاج أي منازعة تطورية: استعمل أقل، وركّب، وأكمل الشوط حتى لا تنجو الخلايا المقاومة جزئيًا فتتكاثر، وابحث عن أهداف جديدة.
مثال 12.13 (نافذة انتقاء الطافرات)
سلالة MIC عندها ؛ وطافراتها المقاومة من الخطوة الأولى، الحاضرة بنسبة واحد في ، MIC عندها . والجرعة التي تبقي الدواء عند تقتل النمط البري وتترك الطافرات تنمو بلا منافسة: فمدى التركيز بين MIC النمط البري وMIC الطافرات هو نافذة انتقاء الطافرات، والعلاج الذي يقع فيها يربّي المقاومة. أما الجرعة فوق فتقتل الاثنين؛ والجرعة المنخفضة جدًا، أو الشوط الموقوف حين يشعر المريض بتحسن ومستوى الدواء يهبط عبر النافذة، هي كيف تُصنع جمهرة مقاومة. والمنطق نفسه يضبط نظم علاج السل: ستة أشهر، وأربعة أدوية، بجرعات فوق MIC كل طافر من خطوة واحدة.
ملاحظة 12.14 (معظم البكتيريا ليست ممرضة)
بكتيريا عيادة هذا الفصل أقلية ضئيلة. فمن المليون نوع المقدَّر، تسبب بضع مئات مرضًا بشريًا؛ وأما الباقي فيدير دورات النتروجين والكبريت والكربون (في كتاب السنة الثانية)، ويثبّت نتروجين كل بقولية، ويهضم السللوز في كل مجترّ، ويؤلف ميكروبيومات الفصل 14، التي يكون فقدها تحت علاج المضادات الحيوية كلفةَ كل شوط. والمضادات الحيوية نفسها جزيئاتها — أسلحة وإشارات تطورت بين بكتيريا التربة والفطور قبل وجود المستشفيات بكثير — وكذلك معظم مورّثات المقاومة.
12.6 تمارين
تمرين 12.1 ★
صِف غلافي إيجابية الغرام وسلبيته وفسّر لماذا تميز بينهما صبغة غرام.
حل
حل التمرين 12.1.
إيجابية الغرام: غشاء هيولي ملفوف بجدار ببتيدوغليكان ثخين متعدد الطبقات تتخلله حموض التيكويك. وسلبية الغرام: طبقة ببتيدوغليكان رقيقة في محيط حول البلازما، ثم غشاء خارجي وريقته الخارجية عديد سكريد شحمي، مع بورينات. ومعقّد البنفسجي البلوري واليود محبوس في الجدار الثخين المجفَّف بالكحول عند إيجابية الغرام (فتكون بنفسجية) لكنه يُغسل من سلبية الغرام عبر جدارها الرقيق وغشائها الخارجي المفكَّك، فتأخذ حينئذ الصبغة المضادة الوردية.
تمرين 12.2 ★
مزرعة من خلية في المليلتر تبلغ في من النمو الأسّي. أوجد عدد الأجيال، وزمن الجيل، و.
حل
حل التمرين 12.2.
زيادة ضعف : أي نحو جيلًا؛ و؛ و.
تمرين 12.3 ★
سمِّ طرق النقل الأفقي الثلاثة وأعطِ التجربة الكلاسيكية التي بيّنت كلًا منها.
حل
حل التمرين 12.3.
التحول — غريفيث (1928) وآفري وماكلاود وماكارتي (1944): فالمكورات الرئوية الفوعة المقتولة بالحرارة تحوّل الحية غير الفوعة، والعامل DNA. والنقل بالعاثيات — زيندر وليدربرغ (1952): فالعاثية P22 تحمل مورّثات Salmonella من سلالة إلى أخرى عبر مرشح يوقف الخلايا. والاقتران — ليدربرغ وتاتوم (1946): فسلالتان معوزتان من E. coli تعطيان مؤتلفات مكتفية حين تُخلطان فقط، وهو ما يقتضي تماسًا خلويًا (أنبوب دافيس على شكل U).
تمرين 12.4 ★
أعطِ هدف البنسلين، والستربتوميسين، والسيبروفلوكساسين، و الريفامبيسين، وقل لماذا يكون كل منها سامًا سمية انتقائية.
حل
حل التمرين 12.4.
البنسلين: ناقلات الببتيد التي تشبّك الببتيدوغليكان، وهي ما لا تملكه خلايا الحيوان. والستربتوميسين: الوحدة الريبوزومية الصغيرة، وصورتها البكتيرية تختلف عن صورة حقيقيات النوى. والسيبروفلوكساسين: جيراز DNA، وهو توبوإيزوميراز بكتيري غائب عن البشر. والريفامبيسين: الوحدة من بوليميراز RNA البكتيري، وهي ما لا يشاركه فيه إنزيم حقيقيات النوى.
تمرين 12.5 ★★
مزرعة كيميائية عندها ، و، و، و. احسب و عند و و h، ومعدل التمديد الذي يبدأ عنده الغسل.
حل
حل التمرين 12.5.
، و. فعند : ، و. وعند : ، و. وعند : ، و. والغسل عند .
تمرين 12.6 ★★
باستعمال القضية 12.7، قارن الكثافة العتبية لاستشعار النصاب في عضو ضوء حبار () وفي ماء بحر جارٍ ()، عند جزيء لكل خلية في الساعة و ( جزيء في اللتر).
حل
حل التمرين 12.6.
. في عضو الضوء: في اللتر في المليلتر. وفي ماء البحر: في اللتر في المليلتر — أي أعلى بألف مرة، ولا تُبلغ أبدًا في البحر.
تمرين 12.7 ★★
طبق انتشار أقراص يُظهر مناطق قدرها و و لثلاثة أدوية. فسّر كلًا منها، وفسّر لماذا يمكن تحويل قطر المنطقة إلى MIC.
حل
حل التمرين 12.7.
: حساسة، وMIC منخفض. و: حساسية منخفضة، متوسطة — وقد تخفق عند الجرعات العادية. و: مقاومة، والنمو حتى القرص. والدواء ينتشر من القرص فيهبط تركيزه مع المسافة هبوطًا قابلًا للتكرار؛ ويتوقف النمو حيث يساوي التركيز MIC، فيرتبط نصف قطر المنطقة وMIC بمنحني معايرة أُقيم بسلالات معلومة MIC.
تمرين 12.8 ★★
فسّر كيف يستطيع حدث اقتران واحد أن يجعل Klebsiella حساسة مقاومةً لخمسة مضادات حيوية، ولماذا كثيرًا ما تُوجد مورّثات المقاومة معًا على بلازميدات.
حل
حل التمرين 12.8.
البلازميد الاقتراني يحمل إنتغرونًا تحوي مصفوفة خزائنه عدة مورّثات مقاومة، إضافةً إلى عناصر قافزة تحمل مزيدًا؛ والبلازميد يعبر في تزاوج واحد ويعبّر عنها كلها. وهي تتجمع لأن الانتقاء لأي من الأدوية يحفظ البلازميد كله، فتدوم المورّثات التي تركبه (وهو الانتقاء المشترك)؛ وتلتقط الإنتغرونات الخزائن؛ وتقفز العناصر القافزة على البلازميدات؛ والبلازميد، لا المورّثة، هو وحدة النقل.
تمرين 12.9 ★★
مريض فيه بكتيريا ويأخذ دواءً تنشأ ضده المقاومة بمعدل لكل انقسام. احسب العدد المتوقع من الخلايا المقاومة في البداية؛ ثم بدواءين مستقلين. ولماذا تكون المعنِّدات مسألة مختلفة؟
حل
حل التمرين 12.9.
الدواء وحده: خلية مقاومة متوقعة. وبدواءين مستقلين: . أما المعنِّدات فليست طافرات: فنسبة صغيرة من الخلايا الساكنة تنجو من أي دواء و تعيد النمو جمهرةً حساسة تمامًا حين يزول الدواء، فلا يفيد دواء ثانٍ؛ ولا يفيد إلا علاج يطول بما يكفي للإمساك بها وهي تستيقظ، أو دواء فعال على الخلايا الساكنة.
تمرين 12.10 ★★★
بيّن أن الحالة المستقرة في المزرعة الكيميائية مستقرة: اضطرب قليلًا فوق وتابع إشارتي و . ثم فسّر لماذا لا يستطيع نوعان يتنافسان على مغذٍّ واحد في مزرعة كيميائية أن يتعايشا عند الحالة المستقرة، وأيهما يغلب عند معطاة.
حل
حل التمرين 12.10.
عند : يتجاوز الاستهلاك الإمداد، فتهبط دون ؛ فتصير و، فتهبط عائدةً؛ ومع هبوط ترتفع من جديد. فيُصحَّح الانحرافان معًا: أي إن الحالة المستقرة مستقرة. وأما نوعان: فيحتاج كل منهما إلى ليدوم، وهذا يثبّت الخاص به؛ ولا يستطيع المغذي أن يأخذ إلا قيمة واحدة، فلا يدوم أكثر من نوع واحد. والذي له الأدنى يدفع دون ما يحتاجه الآخر، فيُغسل الآخر خارجًا؛ وأي النوعين هو ذاك قد يتغير مع إذا تقاطع منحنيا مونو عندهما.
تمرين 12.11 ★★★
المحرّض الذاتي يحرّض سينثازه هو. عدّل نموذج القضية 12.7 بحيث تقفز من إلى حين ، وبيّن أن للنظام حالتين مستقرتين على مدى من الكثافات (وهو التخلّف): فالجمهرة التي فتحت تبقى مفتوحة عند كثافة تكون عندها جمهرة ساذجة مغلقة. فما الفائدة البيولوجية من ذلك؟
حل
حل التمرين 12.11.
بالكثافة ، توجد الحالة المغلقة ما دامت تبقى دون ، أي ؛ وتوجد الحالة المفتوحة ما دامت تبقى فوقها، أي . ومن أجل تتسق الحالتان مع نفسيهما: فالجمهرة التي فتحت تبقي نفسها مفتوحة بناتجها الأعلى، والتي لم تفتح تبقى مغلقة. والفائدة: الالتزام — فمتى قررت مستعمرة أن تبني غشاءً حيويًا أو تطلق ذيفانًا، لم ينقض هبوطٌ في الكثافة القرار، ويكون المفتاح حادًا متزامنًا لا متدرجًا.
تمرين 12.12 ★★★
فسّر نافذة انتقاء الطافرات واستعملها للاحتجاج لكل مما يلي أو عليه: (أ) جرعات عالية لأشواط قصيرة؛ (ب) جرعات منخفضة لأشواط طويلة؛ (ج) التوقف حين تزول الأعراض؛ (د) المعالجة التوليفية.
حل
حل التمرين 12.12.
(أ) جرعات عالية لأشواط قصيرة: يبقى المستوى فوق MIC الطافر ويقتل النمط البري وطافرات الخطوة الأولى سواء بسواء — فمحبَّذة، وتحدّها السمية. (ب) وجرعات منخفضة لأشواط طويلة: يقعد المستوى في النافذة أيامًا فيربّي المقاومة — فمرفوضة. (ج) والتوقف حين تزول الأعراض: فالناجون أقل الخلايا حساسية والمستوى الهابط يمر بالنافذة — فمرفوض. (د) والتوليفة: على الخلية أن تكون مقاومة للاثنين، وهو ما لا يحويه مليار خلية — فمحبَّذة.
12.7 مسألة: مزرعة كيميائية وعيادة
مسألة 12.1
مسألة نهاية الأسبوع — مزرعة نامية في دورق ومحفوظة في مزرعة كيميائية، وبكتيريا مضيئة معدودة حتى نصابها، و خمج معالَج في مواجهة حساب المقاومة، وتنتهي إلى الخلايا في المزرعة الكيميائية، والكثافة التي يضيء عندها الضوء و احتمال أن يلقى شوط الدوائين خلية مقاومة
معطيات: E. coli عند ، و؛ وتزن الخلية . والمزرعة الكيميائية: ، و، و، و، و غلوكوز، و. وVibrio: جزيء محرّض ذاتي لكل خلية في الساعة، و جزيء في اللتر ()، و في عضو الضوء. والخمج: خلية؛ والمقاومة للدواء A عند لكل انقسام، وللدواء B عند ؛ وMIC النمط البري للدواء A ، ولطافر الخطوة الأولى ؛ والجرعة تعطي تهبط بعمر نصف .
الجزء الأول — الدورق.
- خلية واحدة في من المرق. فكم خلية بعد من النمو الأسّي، وما الكثافة في المليلتر؟
- يحتمل المرق على الأكثر خلية في المليلتر. فمتى يتوقف النمو، وما كتلة خلايا المزرعة؟
- كم تستغرق ذرية خلية واحدة لتبلغ كتلة الأرض ( غرام)؟ علّق.
- يدوم طور التلكؤ حين تُلقَّح خلايا من الطور الثابت في وسط طازج، ولا يكاد يوجد حين تُستعمل خلايا أسّية. فسّر.
- احسب من . وإذا بُدّل الوسط بسكر يكون عنده ، فما ، وبأي عامل يهبط عدد الخلايا بعد ؟
- تُنشر عينة من المزرعة الثابتة على طبق فتعطي مستعمرة من من تمديد . فما العدد الحي، ولماذا قد يختلف عن عدّ بالمجهر؟
الجزء الثاني — المزرعة الكيميائية.
- احسب معدل التمديد وزمن الجيل الذي تُجبَر المزرعة على اتخاذه.
- احسب و (بالغرام في اللتر وبالخلايا في المليلتر).
- كم خلية تغادر الوعاء في الساعة؟ وكم جيلًا تمر به المزرعة في شهر؟
- تُرفع المضخة إلى . فما و الجديدان؟ وماذا يحدث عند ؟
- يظهر طافر عنده و نفسه. فعند ، ما الذي يحتاجه، وماذا يحدث للسلالة الأصلية؟ (استعمل التمرين 12.10.)
- شوط شهر هو جيل. فإذا نشأت طفرة نافعة بمعدل لكل انقسام وكان الوعاء يحوي خلية، فكم طفرة نافعة تنشأ في الجيل؟ وماذا يقول ذلك عن التطور في مزرعة كيميائية؟
الجزء الثالث — النصاب.
- احسب الكثافة الخلوية العتبية للضوء في عضو الضوء، بالخلايا في المليلتر.
- يحوي عضو الضوء من البكتيريا عند في المليلتر. فبأي عامل يكون المحرّض الذاتي فوق العتبة؟
- وفي ماء البحر تُكنس الإشارة عند . فما الكثافة العتبية؟ قارنها بعدد خلية في المليلتر في البحر المفتوح.
- بعد أن يطرد الحبار من البكتيريا عند الفجر، كم يمضي حتى تستعيد الباقية البالغة في المليلتر، وهي تنقسم كل ، عدد في المليلتر؟ وهل ينطفئ الضوء في هذه الأثناء؟
- تنفق كل خلية متوهجة نحو من طاقتها على الضوء. فلماذا تُحابى الخلية المظلمة في البحر، ولماذا لا تُحابى في العضو؟
- ممرض يستعمل المنظومة نفسها ليؤجل ذيفاناته حتى يكثر. اقترح استراتيجية دوائية تستثمر ذلك وقل لماذا قد تنتقي المقاومة أبطأ من مضاد حيوي.
الجزء الرابع — العيادة.
- العدد المتوقع من الخلايا المقاومة للدواء A في بداية العلاج؛ وللدواء B؛ وللاثنين.
- احتمال ألا توجد خلية مقاومة للدواء A؛ وللاثنين.
- بعد الجرعة، متى يهبط مستوى الدواء إلى ، وإلى ؟ وكم يقضي في نافذة انتقاء الطافرات لكل جرعة؟
- إذا أُعطي الدواء كل ، فما نسبة الزمن التي يكون فيها المستوى في النافذة، وبماذا يتنبأ ذلك على مدى شوط من عشرة أيام بالدواء A وحده؟
- اقترح تغييرًا في الجرعات يبقي المستوى فوق طوال الوقت (احسب الفترة أو الجرعة اللازمة)، واذكر كلفته.
- خلية واحدة من معنِّدة، ساكنة لا يمسها أي تركيز من أي من الدوائين. فكم ينجو من الشوط، وماذا يحدث حين يُسحب الدواء، وماذا يعني ذلك لطول العلاج؟
- لخّص: الخلايا في المليلتر في المزرعة الكيميائية (السؤال 8)، و الكثافة العتبية للضوء (السؤال 13)، واحتمال أن يلقى شوط الدوائين خلايا غير مقاومة (السؤال 20).
حل
حل المسألة 12.1.
1. جيلًا: أي خلية، و في المليلتر. 2. خلية : أي بعد ؛ والكتلة . 3. خلية: أي جيلًا، و. والمغذيات والأكسجين والفضلات توقفه في يوم؛ فالنمو الأسّي قصير دائمًا. 4. خلايا الطور الثابت قد فككت ريبوزوماتها وكبتت إنزيماتها الاستقلابية؛ فعليها أن تعيد بناءها قبل أن تنقسم. أما الخلايا الأسّية فتصل مجهزة تمامًا. 5. ؛ وعند ، تكون ؛ وبعد يكون بدل : أي أقل بعامل . 6. خلية حية في المليلتر. والمجهر يعدّ أيضًا الخلايا الميتة والتي لن تنمو على الطبق، والكتلة الواحدة تعطي مستعمرة واحدة. 7. ؛ و. 8. ؛ و خلية في اللتر، أي في المليلتر. 9. خلية في الساعة؛ و جيلًا في الشهر. 10. عند : ، و. وعند ، يكون : أي غسل. 11. الطافر يبقي ؛ وعند ذلك الغلوكوز تنمو الأصلية بمعدل وتتناقص مثل : فتُغسل خارجًا على مدى أسابيع قليلة. ويستولي الطافر. 12. طفرة نافعة في الجيل: فالتكيف مستمر، بنسيلة أفضل جديدة تجتاح كل بضع مئات من الأجيال — فالمزرعة الكيميائية آلة تطور. 13. في اللتر خلية في المليلتر. 14. ضعفًا. 15. في اللتر، أي في المليلتر — أي ستة رتب فوق في المليلتر في البحر: فمظلمة. 16. عشرة أضعاف هي مضاعفة، أي . وعند في المليلتر تكون الجمهرة ما تزال فوق العتبة بمقدار ضعف: فيبقى الضوء مفتوحًا. 17. في البحر لا يرى الضوءَ أحد ولا يطعم مضيفًا: فالطافر المظلم يوفر ويفوق المتوهجات نموًا. أما في العضو فينتقي الحبار للضوء — إذ يطرد الغشاشات المظلمة أو لا يطعمها — فتشتري الكلفة بيتًا. 18. احجب المستقبل أو اهدم المحرّض الذاتي (وهو إخماد النصاب): فتعيش البكتيريا لكنها لا تنشر ذيفاناتها قط، ويصفّيها الجهاز المناعي. ولأن البكتيريا الحساسة و“المقاومة” تنمو سواء — إذ لا يُقتل شيء — تكون أفضلية الإفلات من الدواء صغيرة، وينبغي أن تنتشر المقاومة أبطأ منها تجاه دواء قاتل. 19. للدواء A: ؛ وللدواء B: ؛ وللاثنين: . 20. ؛ و. 21. : عمر نصف واحد، أي ؛ و: أربعة، أي ؛ فتكون في النافذة من إلى ، أي لكل جرعة. 22. بجرعة كل : تكون في النافذة من الساعة إلى الساعة ، أي ثلثي الزمن؛ وعلى مدى عشرة أيام يُنتقى لطافرات الخطوة الأولى للدواء A — وهي عشر في البداية — ويخفق A وحده. 23. لإبقائه فوق طوال الوقت: جرعة كل عمر نصف ()، أو جرعة تبلغ ذروة كل ( في ثلاثة أعمار نصف)، أو تسريب مستمر. والكلفة: سمية الذرى العالية، أو ست جرعات في اليوم لا يلتزم بها المرضى. 24. معنِّدة تنجو مهما كانت الأدوية؛ فإذا توقف العلاج استيقظت وأعادت نمو جمهرة حساسة تمامًا — أي انتكاسة. فيجب أن يدوم العلاج بما يكفي للإمساك بها وهي تغادر السكون، ولهذا يستغرق السل ستة أشهر. 25. خلية في المليلتر في المزرعة الكيميائية؛ ويضيء الضوء عند خلية في المليلتر؛ و أن شوط الدوائين لا يلقى خلية مقاومة.