الأحياء الجامعية — السنة الثانية · Bachelor Year 2
2الاستقلاب الجرثومي والأغشية الحيوية
املأ أسطوانة زجاجية بوحل بركة، وقليل من الورق الممزق، وصفار بيضة، وماء، ثم اتركها على حافة نافذة. ففي غضون أسابيع تتطبق في نطق ملونة: طحالب خضراء في الأعلى، وطبقة صدئة، ونطاق أرجواني، وآخر أخضر أدنى منه، ووحل أسود من الكبريتيد في القاع. ولم يُضف شيء سوى الضوء. وكل نطاق جمهرة تعيش على كيمياء مختلفة — على الأكسجين، أو النترات، أو الكبريتات، أو الكبريتيد، أو الهدروجين — ويغذي كل منها الذي يليه. فالأسطوانة هي العالم الجرثومي مصغرًا: خلايا تكسب طاقتها من أي زوج من المواد يستطيع تبادل الإلكترونات تقريبًا، وتدير مجتمعةً الدورات الكيميائية للكوكب. يعرض هذا الفصل منطق تلك الطاقية، وحركية النمو الجرثومي، والحياة الجماعية للجراثيم على السطوح، وهي الطريقة التي يعيش بها معظمها فعلًا.
2.1 طرائق كسب العيش
تعريف 2.1 (أنماط التغذي)
يُصنَّف الكائن بثلاثة أجوبة. مصدر طاقته: الضوء (متغذٍّ ضوئي) أو التفاعلات الكيميائية (متغذٍّ كيميائي). ومصدر إلكتروناته: مواد لاعضوية — ، ، ، ، الماء — (متغذٍّ معدني) أو جزيئات عضوية (متغذٍّ عضوي). ومصدر كربونه: (ذاتي التغذي) أو كربون عضوي (غير ذاتي التغذي). فالنباتات والزراقم ذاتية التغذي ضوئيًا معدنيًا؛ والحيوانات والفطريات وE. coli غير ذاتية التغذي كيميائيًا عضويًا؛ أما بكتيريا النترتة وأكسدة الكبريت فذاتية التغذي كيميائيًا معدنيًا، تصنع مادتها العضوية من بطاقة تستمدها من أكسدة المعادن، في الظلام. وكل تركيب من هذه تقريبًا موجود في مكان ما بين بدائيات النوى؛ أما حقيقيات النوى فلا تشغل إلا اثنين.
مبرهنة 2.2 (طاقة زوج الأكسدة والإرجاع)
كل استقلاب مولّد للطاقة ينقل إلكترونات من زوج واهب إلى زوج متقبل. ولكل زوج كمون معياري (عند pH 7): فكلما كان أشد سلبية كان أسهل إعطاءً للإلكترونات. ونقل مولًا من الإلكترونات من واهب عند إلى متقبل عند يحرر طاقة حرة معيارية
أي إن المردود يتناسب مع المسافة العمودية بين الزوجين على برج الإلكترونات. فمع عند و/الغلوكوز عند ، تعطي إلكترونات جزيء الغلوكوز الأربعة والعشرون ؛ وإذا سُلّمت بدل ذلك إلى الكبريتات (، ) لم تعط الإلكترونات نفسها إلا .
برهان. من أجل التفاعل: الواهب + المتقبل الواهب + المتقبل، يكون تغير الطاقة الحرة هو الشغل الذي يبذله مولًا من شحنة الإلكترون وهي تسقط عبر فرق الكمون ، مع اصطلاح الإشارة أن النقل التلقائي (الإلكترونات نحو الزوج الأكثر إيجابية) له . وهذه علاقة نرنست التي درسها مجلد السنة الأولى، مطبقة على نصفي تفاعل. ∎
قضية 2.3 (التغذي الكيميائي المعدني)
بعض البكتيريا تستمد كل طاقتها من أكسدات لاعضوية، مستعملة الأكسجين (أو النترات) متقبلًا، وتثبّت بما تكسبه من ATP وقدرة إرجاعية. مُنَترِتات: مؤكسدات الأمونيوم (Nitrosomonas) تحول إلى نتريت ()، ومؤكسدات النتريت (Nitrobacter) تحول النتريت إلى نترات ()؛ وهي معًا تحول أمونيوم التحلل إلى النترات التي تمتصها النباتات (الفصل 25). ومؤكسدات الكبريت (Thiobacillus، Beggiatoa) تؤكسد إلى كبريت وكبريتات؛ ومؤكسدات الحديد تؤكسد إلى صدأ؛ ومؤكسدات الهدروجين تحرق . ولأن واهبات إلكتروناتها تقع عاليًا على البرج، يكون المردود لكل جزيء صغيرًا، ولأن واهباتها مرجعات أضعف من NADH، عليها أن تنفق طاقة لدفع الإلكترونات صعودًا لتصنع NADH الذي يحتاجه تثبيت الكربون: فالمُنَترِت يؤكسد نحو ثلاثين شاردة أمونيوم ليثبّت واحدًا، وينمو ببطء.
شواهد. نمّى فينوغرادسكي (1887–1890) بكتيريا كبريتية خيطية في قطرة ماء ترك الكبريتيد ينتشر إليها من جهة والهواء من الجهة الأخرى: فتجمعت عند الحد، وراكمت كريات كبريت، واستهلكتها حين قُطع الكبريتيد. ثم عزل بكتيريا مُنَترِتة على وسط معدني محض فيه أمونيوم ولا كربون عضوي البتة، فنمت عليه وأنتجت نترات — وهو أول برهان على أن الحياة يمكن أن تُبنى من ومن طاقة تفاعل لاعضوي، دون ضوء. وسمّى ذلك التركيب الكيميائي. ∎
تعريف 2.4 (التركيب الضوئي غير المنتج للأكسجين)
تركّب البكتيريا الأرجوانية والخضراء ضوئيًا بجهاز ضوئي واحد وبيكتريوكلوروفيل يمتص في الأشعة تحت الحمراء القريبة، مستعملة أو أو حموضًا عضوية واهبات إلكترون بدل الماء: فهي تطلق كبريتًا أو كبريتات لا أكسجين قط، وتحتاج إلى ضوء بأطوال موجة تنفذ عبر الطبقة الخضراء والزراقمية فوقها. ولذلك تنمو البكتيريا الكبريتية الأرجوانية في النطاق الأرجواني من أسطوانة فينوغرادسكي، حيث يلتقي الكبريتيد الصاعد من الأسفل بالضوء النازل من الأعلى؛ وتنمو تحتها البكتيريا الكبريتية الخضراء، وهي أحمل للكبريتيد وأقنع بالضوء القليل. أما التركيب الضوئي المنتج للأكسجين، بجهازيه الضوئيين على التوالي، فابتكار متأخر لسلالة واحدة — الزراقم — تعلمت أخذ الإلكترونات من الماء.
2.2 التنفسات اللاهوائية والتخمرات
تعريف 2.5 (التنفس اللاهوائي)
التنفس اللاهوائي تنفس — أي سلسلة نقل إلكترونات تضخ البروتونات وتصنع ATP بالتناضح الكيميائي — بمتقبل نهائي غير الأكسجين. فنازعات النترتة (Pseudomonas، Paracoccus) ترجع النترات إلى نتريت، ثم أكسيد نتريك، ثم أكسيد نيتروز، وأخيرًا الذي يفلت إلى الهواء؛ وهي تستعمل سلسلتها الهوائية مع بضعة إنزيمات مضافة، ولا تنتقل إلى النترات إلا حين يزول الأكسجين. ومرجعات الكبريتات (Desulfovibrio) ترجع الكبريتات إلى كبريتيد، فتسوّد الوحل بكبريتيد الحديد وتكسبه رائحته. ومولّدات الميثان، وهي عتائق، ترجع بالهدروجين إلى ميثان (، )، أو تشق الأسيتات إلى ميثان و؛ ويقتلها الأكسجين، وتعيش في كروش الأبقار وحقول الأرز والمستنقعات والمطامر، ومنها تطلق غاز دفيئة هو موضوع الفصل 27. وتخدم أكاسيد الحديد والمنغنيز مجموعات أخرى. وقد عالج مجلد السنة الأولى الأكسجين بوصفه المتقبل؛ أما في معظم تاريخ الأرض، وفي كل رسابة اليوم، فليس إلا أول سلسلة.
قضية 2.6 (تعاقب المتقبلات في رسابة)
بالنزول عبر رسابة مشبعة بالماء، تُستنفد متقبلات الإلكترون بترتيب الطاقة التي تعطيها: الأكسجين في الميليمترات الأولى، ثم النترات، ثم أكاسيد المنغنيز والحديد، ثم الكبريتات، وأخيرًا (توليد الميثان) في أعمق طبقة لاأكسجينية. والترتيب هو ترتيب البرج: فعند كل عمق تنمو الكائنات التي تستعمل أفضل متقبل باقٍ أسرع من غيرها، فتغلب البقية على الواهبات العضوية، وتستنفد متقبلها قبل أن تتسلم المجموعة التالية. وفي البحر، حيث الكبريتات وفيرة ()، يكون نطاق الكبريتات سميكًا ولا يبدأ توليد الميثان إلا على عمق أمتار؛ أما في مستنقع عذب فقير بالكبريتات فيتكون الميثان تحت السطح مباشرة.
تعريف 2.7 (التخمر، مرة أخرى)
التخمر لا يستعمل متقبلًا خارجيًا: فالركيزة العضوية تُشق إلى ناتج أكثر أكسدة وآخر أكثر إرجاعًا، ولا يُصنع ATP إلا بالفسفرة على مستوى الركيزة، ويُعاد أكسدة NADH الناتج من التحلل السكري بإرجاع مستقلَب. فالخمائر تصنع الإيثانول و؛ والبكتيريا اللبنية تصنع اللاكتات (اللبن الرائب، ومخلل الملفوف، والعضلات الموجعة)؛ وE. coli تصنع خليطًا من الحموض والإيثانول والغازات؛ والمطثيات تصنع البوتيرات والبوتانول والأسيتون؛ والبروبيونيات تصنع البروبيونات و اللذين في الجبن السويسري. والمردود اثنان من ATP لكل غلوكوز في مقابل نحو ثلاثين بالتنفس، فعلى المخمّر أن يعالج سكرًا أكثر بخمس عشرة مرة للنمو نفسه، ونواتجه — حموض وكحول — تسمّم وسطه: فالتخمرات تحفظ الطعام لأن المخمّر يجعل الطعام غير صالح للسكنى، حتى لنفسه.
مثال 2.8 (التغذي التعاوني: العيش على البقية)
في رسابة لاأكسجينية تترك المخمّرات وراءها الأسيتات والبروبيونات والبوتيرات و. وأكسدة البروبيونات إلى أسيتات و لها طاقة حرة معيارية موجبة () وهي مستحيلة — ما لم يستهلك مولّد ميثان مجاور الهدروجين بسرعة تكوّنه، فيُبقي ضغطه الجزئي دون ، وعندها يصير التفاعل مولّدًا للطاقة. ولا يستطيع أي من الشريكين النمو وحده على البروبيونات؛ وهما معًا يحولانه إلى ميثان. وهذا النقل البينوعي للهدروجين هو سبب كون الهضم اللاهوائي دائمًا عمل جماعة، وسبب وجدان العتيقة وشريكتها البكتيرية ملتصقتين إحداهما بالأخرى في كثير من الأحيان.
2.3 النمو على ركيزة
مبرهنة 2.9 (قانون مونو)
جمهرة تنمو على ركيزة محدِّدة واحدة تركيزها يكون معدل نموها النوعي
حيث تركيز الكتلة الحيوية، و المعدل الأقصى (مقلوب أقصر زمن جيل مقسومًا على )، و ثابت نصف الإشباع، أي تركيز الركيزة الذي يجري عنده النمو بنصف سرعته — بضعة مليغرامات من الغلوكوز في اللتر عند E. coli. وتُستهلك الركيزة بنسبة النمو، ، حيث هو المردود: غرامات الكتلة الحيوية لكل غرام ركيزة، وهو نحو في النمو الهوائي على السكر و عند مخمّر.
شواهد. نمّى مونو (1942) E. coli في دفعات على سلسلة من تراكيز الغلوكوز وقاس المعدل الأسّي لكل منها: فارتفعت المعدلات مع التركيز ثم أشبعت، على شكل منحني ميكايليس–منتن، وهو ما يُتوقع إذا كان المعدل تحدده جملة اقتناء قابلة للإشباع. والقانون تجريبي — فللخلية آلاف الإنزيمات لا إنزيم واحد — لكنه يوافق كل مزرعة محدودة الركيزة تقريبًا، وهو أساس تقانة التخمير وهندسة معالجة المياه المستعملة. ∎
مبرهنة 2.10 (المزرعة الكيميائية المستقرة)
المزرعة الكيميائية المستقرة وعاء حجمه يُغذَّى بوسط طازج (ركيزته ) بتدفق ويُفرَّغ بالتدفق نفسه، فيكون معدل التمديد . وتخضع الكتلة الحيوية والركيزة إلى
وفي الحالة المستقرة : أي إن المزرعة تنمو بالسرعة نفسها التي تُغسل بها، مهما كان دون قيمة حرجة، فيضبط المشغّل معدل النمو بإدارة المضخة. أما الركيزة والكتلة الحيوية في الحالة المستقرة فهما
وفوق معدل الغسل لا تستطيع أي جمهرة الصمود.
برهان. بوضع مع نجد ؛ وبقلب قانون مونو، ، ومنه . وبوضع وتعويض بالمقدار : ، ومنه . ولا يوجد الحل إلا ما دام ، أي ؛ وبعد ذلك يكون من أجل كل ويؤول إلى الصفر. والحالة المستقرة مستقرة: فإذا ارتفع هبط ، فهبط دون ، فأُعيد بالغسل إلى أسفل. ∎
مثال 2.11 (قراءة مزرعة مستقرة)
مع ، و، و، و، عند : يكون و؛ فتترك المزرعة من السكر دون استعمال. ومعدل الغسل هو . ويعمل الهاضم أو الأمعاء بالمبدأ نفسه: فالقولون البشري، الذي يُغذَّى ثلاث مرات في اليوم ويُفرَّغ مرة، يبقي بكتيرياه عند معدل تمديد قريب من ، وكل نوع لا يستطيع التضاعف خلال يوم يُغسل خارجًا — ما لم يتشبث بالجدار.
2.4 الأغشية الحيوية
تعريف 2.12 (الغشاء الحيوي)
الغشاء الحيوي جماعة من الكائنات المجهرية ملتصقة بسطح ومغروسة في حشوة من عديدات السكريد والبروتينات وDNA خارج خلوي تنتجها بنفسها. ويتكون على مراحل: التصاق عكوس لخلايا مفردة (بالأسواط والأهلاب)، ثم التصاق لاعكوس ونمو مستعمرات مجهرية، ثم نضج إلى غشاء مبنيّ فيه أبراج وقنوات ماء، ثم تشتت لخلايا تسبح بعيدًا لتبذر سطوحًا جديدة. والحشوة تمسك الماء والمغذيات، وتحمي الخلايا من الجفاف والراعيات والصادات والخلايا المناعية، وتقيم تدرجات كيميائية تجعل الغشاء منظرًا من المساكن البيئية. وهكذا تعيش معظم بكتيريا الأرض: على صخور الجداول، وعلى الجذور، وعلى الأسنان (اللويحة السنية)، وعلى القثاطر والغرسات، وفي رئتي مريض التليف الكيسي، وعلى هياكل السفن وفي الأنابيب.
مبرهنة 2.13 (التدرجات داخل غشاء حيوي)
في غشاء ثخنه تستهلك خلاياه الأكسجين بمعدل حجمي ثابت ، مع إبقاء التركيز عند على السطح ولا تدفق عبر الحامل، يكون مَنْحى الأكسجين في الحالة المستقرة قطعًا مكافئًا، وإذا كان الغشاء سميكًا بما يكفي لينفد الأكسجين، نفد عند عمق النفاذ
حيث معامل الانتشار الفعلي في الحشوة. فمع ، و، و (غشاء كثيف من خلايا متنفسة)، يكون : أي إن الغشاء الحيوي دون عُشر المليمتر لاأكسجيني، وتعيش نازعات النترتة والمخمّرات ومرجعات الكبريتات تحت سقف من الهوائيات.
برهان. ليكن العمق تحت السطح. في الحالة المستقرة لا يتغير التدفق الانتشاري مع العمق إلا بالاستهلاك: . وبالمكاملة مرتين، . وإذا انعدم الأكسجين عند العمق بتدفق معدوم هناك (إذ لا يأتي شيء من الأسفل)، كان و: فالثانية تعطي ، والأولى تعطي عندئذ ، أي . والمنحى هو . ∎
قضية 2.14 (استشعار النصاب)
البكتيريا تعدّ نفسها. فكل خلية تفرز جزيئة إشارة صغيرة، محرّضًا ذاتيًا (لاكتونات أسيل-هوموسيرين عند سلبيات الغرام، وببتيدات قصيرة عند إيجابياتها)، بمعدل ثابت منخفض. وفي معلق مخفف تنتشر الإشارة بعيدًا؛ أما في جمهرة كثيفة أو غشاء حيوي فتتراكم، وفوق تركيز عتبي ترتبط بمستقبل يشغّل طائفة من المورّثات — منها مورّثة المحرّض الذاتي نفسه، ومن هنا اسمه. والمورّثات التي تُضبط هكذا هي التي لا تجدي إلا حين تعمل خلايا كثيرة معًا: التلألؤ، وإفراز الإنزيمات الهاضمة والذيفانات، وإنتاج الحشوة، وفوعة الممرضات التي عليها أن تغمر المضيف دفعة واحدة لا أن تنبهه خلية خلية.
شواهد. وجد نيلسون وبلات وهاستينغز (1970) أن البكتيريا البحرية Vibrio fischeri، التي تضيء عضو حبّار، مظلمة في المزرعة المخففة ولا تتوهج إلا فوق نحو خلية في المليلتر؛ وأن وسطًا خاليًا من الخلايا مأخوذًا من مزرعة كثيفة متوهجة يجعل مزرعة مخففة تتوهج في الحال. فالوسط كان يحوي الإشارة؛ وحُدّدت بنيتها، وهي لاكتون أسيل-هوموسيرين، سنة 1981، والطافرات العاجزة عن صنعها لا تتوهج أبدًا مهما كثفت. ∎
مثال 2.15 (لماذا ينجو غشاء حيوي من الصادات)
تنجو خلايا الغشاء الحيوي من تراكيز صادّ تفوق بمئة إلى ألف مرة تلك التي تقتل السلالة نفسها في معلق، دون أي مورّثة مقاومة. فالحشوة تبطئ انتشار الدواء وتربط بعضه؛ والتدرجات تترك الخلايا العميقة جائعة ولاأكسجينية ولا تكاد تنمو، ومعظم الصادات لا تقتل إلا الخلايا النامية (البنسلينات تحتاج إلى اصطناع الجدار، والأمينوغليكوزيدات تحتاج إلى نقل فعال)؛ وقليل من الخلايا المثابرة ساكن تمامًا ويعيد إنماء الغشاء حين يتوقف العلاج. ولذلك يُعالَج خمج مزمن على غرسة عادةً بنزع الغرسة.
2.5 الجماعات الجرثومية
مثال 2.16 (أسطوانة فينوغرادسكي، مشروحة)
يدخل الضوء والهواء من الأعلى؛ وتأتي المادة العضوية والكبريتات من الوحل. فتنمو الزراقم والطحالب في الأعلى وتطلق الأكسجين. وتحتها تستنفد غير ذاتيات التغذي الأكسجين على المادة العضوية، ثم النترات؛ وأعمق منها ترجع مرجعات الكبريتات الكبريتات إلى كبريتيد ينتشر صاعدًا فيسوّد الوحل بكبريتيد الحديد. وحيث يلتقي الكبريتيد الصاعد بالضوء النازل، تؤكسده البكتيريا الكبريتية الأرجوانية ضوئيًا (النطاق الأرجواني)، وتحتها البكتيريا الكبريتية الخضراء؛ وحيث يلتقي الكبريتيد بالأكسجين، في الظلام، تكسب مؤكسدات الكبريت عديمة اللون مثل Beggiatoa عيشها بالتغذي الكيميائي المعدني (الحجاب الأبيض)؛ وحيث يلتقي الحديد المرجع بالأكسجين، تترك مؤكسدات الحديد نطاقًا صدئًا. فالكبريت يدور بين كبريتيد وكبريتات داخل الأسطوانة؛ والكربون يدور بين ومادة عضوية؛ ولا يدخل إلا الضوء ولا يخرج إلا الحرارة. فهي نظام بيئي مغلق بميزان طاقة مفتوح، ونموذج مصغر لقاع المحيط.
ملاحظة 2.17 (الحصر الجرثومية والأرض المبكرة)
حول الينابيع الحارة وعلى السهول المدّية، تحشر حصر جرثومية مطبقة ثخنها بضعة مليمترات الأسطوانة كلها في ثخن يستطيع الضوء عبوره: زراقم في الأعلى، وبكتيريا أرجوانية تحتها، ومرجعات كبريتات في القاعدة، وكل طبقة تستهلك ما تنتجه التي فوقها، والحصيرة تهاجر صاعدة عبر الرسابة التي تحبسها. والحصر المتحجرة — الستروماتوليت — هي أقدم دليل على الحياة، وعمرها مليار سنة. فطوال ملياري سنة، قبل النباتات والحيوانات، كان المحيط الحيوي هذه الحصر والعوالق فوقها، وهي التي ملأت الهواء بالأكسجين (الفصل 25).
2.6 تمارين
تمرين 2.1 ★
صنّف بحسب مصدر الطاقة ومصدر الإلكترونات ومصدر الكربون: زُراق؛ وNitrosomonas؛ وE. coli على الغلوكوز؛ وبكتيريا أرجوانية غير كبريتية تنمو في الضوء على السكسينات؛ وThiobacillus على في الظلام.
حل
حل التمرين 2.1.
الزُّراق: ذاتي التغذي ضوئيًا معدنيًا (الضوء، والماء، و). وNitrosomonas: ذاتي التغذي كيميائيًا معدنيًا (أكسدة الأمونيوم، و). وE. coli على الغلوكوز: غير ذاتي التغذي كيميائيًا عضويًا. والبكتيريا الأرجوانية غير الكبريتية على السكسينات في الضوء: غير ذاتية التغذي ضوئيًا عضويًا. وThiobacillus على الكبريتيد في الظلام: ذاتي التغذي كيميائيًا معدنيًا.
تمرين 2.2 ★
اذكر متقبلات الإلكترون في التنفس بترتيب تناقص المردود الطاقي، وقل أين يُستعمل كل منها في رسابة.
حل
حل التمرين 2.2.
الأكسجين (ميليمترات السطح)، ثم النترات (تحتها مباشرة، حيث زال الأكسجين)، ثم أكاسيد المنغنيز والحديد (الانتقال من البني إلى الرمادي)، ثم الكبريتات (الطبقة الكبريتيدية السوداء، وهي سميكة في الرسابات البحرية)، ثم لتوليد الميثان (الأعمق، أو تحت السطح مباشرة في ماء عذب فقير بالكبريتات).
تمرين 2.3 ★
وازن أكسدة الغلوكوز إلى بنترات مرجعة إلى (في وسط حمضي، والماء هو الناتج الآخر). فكم شاردة نترات لكل غلوكوز؟
حل
حل التمرين 2.3.
: أي 4.8 شاردة نترات لكل غلوكوز (فكل نترات تتقبل 5 إلكترونات، وكل غلوكوز يعطي 24).
تمرين 2.4 ★
عرّف الغشاء الحيوي وسمِّ مراحله الأربع. واذكر ثلاثة مواضع تهم فيها الأغشية الحيوية صحة الإنسان أو الصناعة.
حل
حل التمرين 2.4.
جماعة جرثومية ملتصقة بسطح ومغروسة في حشوة من عديدات السكريد والبروتينات وDNA تصنعها بنفسها. والمراحل: الالتصاق، ثم المستعمرة المجهرية وإفراز الحشوة، ثم النضج بالأبراج والقنوات، ثم التشتت. واللويحة السنية والنخر؛ وأخماج القثاطر والغرسات (والرئتان في التليف الكيسي)؛ وتوسخ الأنابيب والهياكل وتآكلها — أو، على وجه النفع، المرشحات الراشحة في معالجة المياه.
تمرين 2.5 ★★
احسب من أجل انطلاقًا من الكمونين () و (). وكم جزيء ATP (عند ) يستطيع مولّد الميثان صنعه على الأكثر لكل ؟ وعلّق على معدل نموه.
حل
حل التمرين 2.5.
تسقط ثمانية إلكترونات من إلى : لكل ميثان (والقيمة المجدولة )، أي لكل : أي 0.7 من ATP لكل هدروجين على الأكثر، ونحو نصف واحد عمليًا. والطاقة لكل جزيء ركيزة صغيرة إلى حد يجعل مولّدات الميثان تنمو ببطء (أزمنة جيل من ساعات إلى أيام) وتحوّل جل ركيزتها إلى غاز لا إلى خلايا.
تمرين 2.6 ★★
بكتيريا لها و من الغلوكوز. احسب وزمن الجيل عند 1 و5 و. وعند أي تركيز تنمو بنسبة من أقصاها؟
حل
حل التمرين 2.6.
: أي ()، و ()، و (). وعند تسعين في المئة: .
تمرين 2.7 ★★
مزرعة مستقرة لها ، و، و، و، تعمل عند . احسب و وإنتاج الكتلة الحيوية لكل لتر في الساعة ومعدل الغسل.
حل
حل التمرين 2.7.
؛ و؛ والإنتاج ؛ ومعدل الغسل .
تمرين 2.8 ★★
أكسدة واحد إلى نتريت تعطي ؛ ويقبض المُنَترِت ربعها بصيغة ATP ()، ويكلف تثبيت واحد في الكتلة الحيوية ما يعادل 12 جزيء ATP. فكم شاردة أمونيوم عليه أن يؤكسد لكل كربون مثبَّت؟ ولماذا يكون مردود المُنَترِت ضئيلًا هكذا بالقياس إلى مردود غير ذاتي التغذي؟
حل
حل التمرين 2.8.
المقبوض: ، أي 1.4 من ATP لكل أمونيوم؛ ومنه ، أي نحو تسع شوارد أمونيوم لكل كربون — وأضعاف ذلك متى حُسبت كلفة صنع NADH بدفع الإلكترونات صعودًا من النتريت. أما غير ذاتي التغذي فيحصل على كربونه مرجعًا منظمًا سلفًا، وعلى ثلاثين ATP لكل غلوكوز؛ في حين على المُنَترِت أن يشتري طاقته وقدرته الإرجاعية معًا من واهب فقير وأن يبني كل كربون من ، فيحول كسرًا ضئيلًا من الركيزة التي يعالجها إلى خلايا.
تمرين 2.9 ★★
احسب عمق نفاذ الأكسجين في غشاء حيوي له ، و، و. وماذا يحدث للمقدار إذا تضاعف أكسجين الحجم؟ وإذا تنفست الخلايا أسرع بأربع مرات؟
حل
حل التمرين 2.9.
. ومضاعفة تضرب في : ؛ وتربيع ينصّفه: .
تمرين 2.10 ★★★
تنبّأ بنطق أسطوانة فينوغرادسكي من الأعلى إلى الأسفل، مسمّيًا استقلاب كل نطاق، واشرح (أ) لماذا يتكون النطاق الأرجواني حيث يتكون، (ب) ولماذا يسودّ الوحل، (ج) وبأي معنى تكون الأسطوانة جملة مغلقة وبأي معنى تكون مفتوحة.
حل
حل التمرين 2.10.
من الأعلى إلى الأسفل: ماء فيه طحالب وزراقم (تركيب ضوئي منتج للأكسجين)؛ ثم نطاق صدئ من مؤكسدات الحديد حيث يلتقي بالأكسجين؛ ثم حجاب أبيض من مؤكسدات الكبريت عديمة اللون (متغذيات كيميائية معدنية) حيث يلتقي الكبريتيد بالأكسجين؛ ثم نطاق أرجواني من بكتيريا كبريتية أرجوانية (تركيب ضوئي غير منتج للأكسجين على الكبريتيد)؛ ثم نطاق أخضر من بكتيريا كبريتية خضراء (الشيء نفسه، تحتمل كبريتيدًا أكثر وضوءًا أقل)؛ ثم وحل أسود من مخمّرات ومرجعات كبريتات. (أ) تحتاج البكتيريا الكبريتية الأرجوانية إلى الضوء من الأعلى والكبريتيد من الأسفل معًا، فتقع عند السطح البيني حيث يتقاطع التدرجان. (ب) وتصنع مرجعات الكبريتات الذي يرسّب الحديد كبريتيدًا أسود FeS. (ج) وهي مغلقة من جهة المادة: فالكبريت والكربون والنتروجين تدور بين صور مؤكسدة ومرجعة دون أن تخرج؛ ومفتوحة من جهة الطاقة: فالضوء يدخل والحرارة تخرج، ودون ضوء تتوقف كل دورة.
تمرين 2.11 ★★★
كل خلية من جمهرة كثافتها (خلية في اللتر) تفرز محرّضًا ذاتيًا بمعدل جزيئات في الثانية؛ وتتحلل الجزيئة بمعدل . اكتب تركيز الحالة المستقرة بدلالة . ويشتغل المستقبل عند : احسب الكثافة العتبية بالخلايا في المليلتر. وقارنها بمزرعة كثيفة ( في المليلتر) وبماء البحر ( في المليلتر)، واشرح لماذا يبلغ غشاء حيوي النصاب في حجم لا يبلغه فيه معلق أبدًا.
حل
حل التمرين 2.11.
الإنتاج ، والفقد : ومنه . و جزيئة في اللتر؛ فيكون في اللتر، أي في المليلتر. فالمزرعة الكثيفة () فوق العتبة، وماء البحر () دونها بأربع رتب من القدر. وفي الغشاء الحيوي تقع الخلايا عند في مليلتر من الحشوة، وتبطئ الحشوة إفلات الإشارة (فتخفض فعليًا)، فتبلغ مستعمرة مجهرية من بضعة آلاف خلية في نانولتر النصابَ، بينما لا تبلغه الخلايا نفسها أبدًا لو تشتتت في لتر.
تمرين 2.12 ★★★
«بدائيات النوى تدير كيمياء الكوكب.» ناقش هذا بثلاث عمليات من هذا الفصل لا يستطيع أي حقيقي نواة القيام بها، قائلًا في كل منها ماذا يحدث للمحيط الحيوي لو توقفت.
حل
حل التمرين 2.12.
تثبيت النتروجين (فالنتروجيناز لا يوجد إلا عند بدائيات النوى): لو توقف لنزف النتروجين المؤتلف في المحيط الحيوي بنزع النترتة وانهار الإنتاج في غضون عقود. والنترتة ونزع النترتة (عند بدائيات النوى وحدها): لو توقفتا لتراكم الأمونيوم وزالت النترات، ولما عاد النتروجين إلى الهواء أبدًا. وتوليد الميثان والتنفس اللاهوائي (عند بدائيات النوى وحدها): لو توقفا لتراكمت المادة العضوية في الرسابات اللاأكسجينية والكروش والمستنقعات دون تمعدن ولغادر الكربون الدورة؛ وكذلك كان التركيب الضوئي المنتج للأكسجين ابتكارًا بكتيريًا، ولولاه لما كان ثمة أكسجين يُتنفس. فحقيقيات النوى إضافة متأخرة وضيقة كيميائيًا إلى كوكب لبدائيات النوى.
2.7 مسألة: محطة معالجة المياه المستعملة
مسألة 2.1
مسألة نهاية الأسبوع — مجاري بلدة تُحلَّل بوصفها جملة من المفاعلات الجرثومية، من طاقية بكتيرياها إلى الميثان الذي يشغّلها، وتنتهي إلى ميزان طاقة المحطة
تعالج محطة من المجاري في اليوم تحمل من المادة العضوية، مقيسة بالأكسجين اللازم لحرقها (طلبها الكيميائي من الأكسجين، COD)، و من نتروجين الأمونيوم. وللمحطة حوض مهوّى من الحمأة المنشّطة، وحوض لاأكسجيني لنزع النترتة، وهاضم لاهوائي للحمأة. والمعطيات: غير ذاتيات التغذي الهوائية تحوّل المادة العضوية بمردود (كيلوغرام من COD الكتلة الحيوية لكل كيلوغرام من COD الركيزة، فيُؤكسد الباقي)؛ وتحتاج النترتة إلى من لكل كيلوغرام من النتروجين؛ ويحتاج نزع النترتة إلى من COD الركيزة لكل كيلوغرام من نتروجين النترات؛ وتوصل التهوية من لكل كيلوواط ساعة؛ ويتحول COD الحمأة إلى ميثان في الهاضم بنسبة ، ويعطي كل كيلوغرام من COD المحوّل من الميثان محتواه الطاقي ، يُحرق في مولّد مردوده الكهربائي . والمُنَترِتات: ، و من نتروجين الأمونيوم.
الجزء الأول — الطاقية.
- باستعمال برج الإلكترونات، احسب لأكسدة مول واحد من الغلوكوز (24 إلكترونًا عند ) بالأكسجين ().
- احسبها من أجل نترات مرجعة إلى () ومن أجل كبريتات مرجعة إلى كبريتيد ().
- لماذا لا يبدأ نزع النترتة إلا في الحوض اللاأكسجيني، ولماذا يكون إرجاع الكبريتات (برائحته) علامة على محطة سيئة التشغيل؟
- إذا قبضت الخلايا من الطاقة الحرة بصيغة ATP ()، فكم جزيء ATP لكل غلوكوز يعطي كل من الاستقلابات الثلاثة؟
- كم ضعفًا من الغلوكوز على مرجع الكبريتات أن يعالج بالقياس إلى هوائي للنمو نفسه؟
- تحصل المخمّرات في الهاضم على 2 ATP لكل غلوكوز. فسّر لماذا لا ينتج الهاضم مع ذلك كتلة حيوية تُذكر بل غازًا في معظمه.
الجزء الثاني — الحوض المهوّى.
- احسب الحمولة اليومية من المادة العضوية، بكيلوغرامات COD.
- احسب الكتلة الحيوية المنتجة في اليوم (بصيغة COD) والأكسجين اللازم لأكسدة الباقي.
- احسب طاقة التهوية اللازمة للمادة العضوية، بالكيلوواط ساعة في اليوم.
- احسب الحمولة اليومية من النتروجين والأكسجين اللازم لنترتتها.
- تُحتجز الحمأة في الحوض زمنًا وسطيًا (مقلوب معدل تمديدها). فدون أي تُغسل المُنَترِتات خارجًا مهما كان تركيز الأمونيوم؟
- مع ، احسب تركيز الأمونيوم المتبقي في الصبيب.
- يخفض الشتاء إلى . أعد حساب الأمونيوم المتبقي وقل ماذا على المشغّل أن يفعل.
الجزء الثالث — نزع النترتة والهاضم. تُعاد النترات المصنوعة في الحوض المهوّى إلى الحوض اللاأكسجيني، حيث ترجعها غير ذاتيات التغذي بالمادة العضوية الواردة.
- احسب المادة العضوية (بكيلوغرامات COD في اليوم) التي يستهلكها نزع نترتة النتروجين كله.
- احسب كتلة النتروجين المطلوقة إلى الهواء بصيغة في اليوم، وكتلة الخارج في الصبيب بصيغة أمونيوم (السؤال 12)، ككسر من الحمولة.
- تلك المادة العضوية لم تعد تحتاج إلى تهوية. احسب الأكسجين الموفَّر، وطلب المحطة الكلي من الأكسجين (المادة العضوية الباقية زائد النترتة).
- تذهب الحمأة المنتجة (السؤال 8، محفوظة بصيغة COD) إلى الهاضم. احسب الميثان المنتج في اليوم.
- احسب طاقة ذلك الميثان والكهرباء التي يعطيها.
- احسب كهرباء التهوية اللازمة لطلب الأكسجين الكلي في السؤال 16، وقارن.
الجزء الرابع — المفاعل ذو الغشاء الحيوي. ينمّي مرشح راشح غشاءً حيويًا على الحصى؛ ويحمل ماء الحجم من الأكسجين، مع ، ويتنفس الغشاء عند .
- اشتق منحى الأكسجين في غشاء سميك بما يكفي ليصير لاأكسجينيًا.
- احسب عمق النفاذ.
- ثخن الغشاء . فما الكسر الهوائي منه، وماذا تفعل الخلايا تحته بالنترات المنتشرة نزولًا من الطبقة الهوائية؟
- اشرح لماذا يستطيع غشاء حيوي واحد أن ينترت وينزع النترتة في آن، وهو ما لا يستطيعه الحوض المهوّى.
- يُضاف الكلور لتطهير الصبيب. اذكر سببين لنجاة الغشاء الحيوي من جرعة تقتل البكتيريا نفسها في معلق.
- اذكر النتيجة: طلب المحطة اليومي من الأكسجين، وإنتاجها من الميثان، وكسر كهرباء تهويتها الذي يوفره الميثان.
حل
حل المسألة 2.1.
1. . 2. النترات: ؛ والكبريتات: . 3. يعطي الأكسجين أكثر، فتغلب الهوائيات نازعات النترتة على المادة العضوية ما دام الأكسجين موجودًا، والأكسجين يكبت مختزلات النترات؛ أما إرجاع الكبريتات فيحتاج إلى انعدام الأكسجين وإلى غياب النترات، فرائحته تعني أن الحوض ناقص التهوية والنترات مستنفدة — و سام ويأكل الخرسانة. 4. من ATP؛ و؛ و. 5. نحو ست مرات أكثر (). 6. جزيئان من ATP لكل غلوكوز يعنيان مردودًا نحو ، فتبقى من طاقة الركيزة في النواتج (حموض، وكحول، و)، وهي التي تحولها مولّدات الميثان إلى ميثان بكسب ضئيل مثله؛ فطاقة قليلة، وكتلة حيوية قليلة، والكربون يغادر غازًا. 7. من COD في اليوم. 8. الكتلة الحيوية من COD؛ أما الباقية من COD فتُؤكسد وتحتاج إلى من . 9. في اليوم. 10. من النتروجين؛ و من . 11. في الحالة المستقرة : فالغسل يقع دون . 12. : ومنه . 13. ، ويرتفع حد الغسل إلى ؛ وعلى المشغّل أن يطيل عمر الحمأة (بطرح حمأة أقل): فعند يعود . 14. من COD في اليوم. 15. أمونيوم الصبيب ، أي من الحمولة؛ أما الباقي، وهو من النتروجين، فيغادر بصيغة : أي . 16. الموفَّر: من . والطلب الكلي: من في اليوم. 17. من الميثان في اليوم. 18. ؛ والكهرباء في اليوم. 19. التهوية في اليوم: فالميثان يغطي منها . 20. ، ومنه ؛ ومع و: و، مع . 21. . 22. هوائي. وتحته ترجع نازعات النترتة النتراتِ المنتشرة نزولًا من الطبقة السطحية المُنَترِتة إلى ، مستعملة المادة العضوية المنتشرة إلى الداخل. 23. داخل غشاء واحد ينشئ تدرج الأكسجين طبقة هوائية (نترتة) فوق طبقة لاأكسجينية (نزع نترتة)، تفصلهما بضع عشرات من الميكرومترات؛ أما الحوض المهوّى فأكسجيني في كل مكان، فيحتاج نزع النترتة إلى حوض لاأكسجيني منفصل. 24. يتفاعل الكلور مع بوليمرات الحشوة وتستهلكه قبل أن يبلغ الخلايا العميقة؛ والخلايا العميقة جائعة بطيئة النمو أو ساكنة وأقل حساسية بكثير؛ فلا تموت إلا الطبقة السطحية وينمو الغشاء من جديد من الأسفل. 25. طلب الأكسجين في اليوم؛ والميثان في اليوم؛ ويوفر الميثان من كهرباء التهوية ( من ).