Chemistry · Livro 4 · Bachelor Year 3

Química universitária — 3.º ano

Química universitária — 3.º ano · Bachelor Year 3

24Química bioinorgânica

Nosso sangue é vermelho por causa do ferro; o sangue de um límulo é incolor em suas veias e fica azul ao ar, porque transporta o oxigênio sobre o cobre. A vida usa um punhado de íons metálicos para as tarefas que nenhum grupo orgânico consegue fazer: ligar o oxigênio de modo reversível, deslocar elétrons um a um, quebrar a água, reduzir o nitrogênio, tornar uma molécula de água ácida o bastante para atacar o dióxido de carbono. Este capítulo lê essas tarefas com as ferramentas da química de coordenação: ácidos duros e moles, campos ligantes e estados de spin, equilíbrios e leis de velocidade, e termina com os metais usados como fármacos.

O que você já sabe

O volume do 2.º ano tratou dos α\alpha-aminoácidos, das cadeias laterais e dos peptídeos, das nucleobases e dos nucleotídeos, dos complexos de coordenação, dos campos ligantes, do spin alto e baixo, e dos nucleófilos e eletrófilos duros e moles; o volume do 1.º ano, das constantes de complexação e da escala de pL. O Capítulo 18 e o Capítulo 19 deram os espectros, a teoria de Marcus e a aquação da cisplatina, o Capítulo 13, a cinética de Michaelis–Menten, e o Capítulo 8, o tempo de relaxação T1T_1.

Um límulo do Atlântico. Seu sangue transporta o oxigênio sobre a hemocianina, uma proteína de cobre, e é azul quando oxigenado. Fotografia: Kaldari, CC0.
Um límulo do Atlântico. Seu sangue transporta o oxigênio sobre a hemocianina, uma proteína de cobre, e é azul quando oxigenado. Fotografia: Kaldari, CC0.

24.1 Os metais na biologia

Definição 24.1 (Metaloproteínas)

Uma metaloproteína é uma proteína que contém íons metálicos ligados; uma metaloenzima é uma metaloproteína que catalisa uma reação. Um cofator é uma espécie não proteica, um íon metálico ou uma molécula pequena, ligada a uma proteína e necessária à sua atividade.

Os metais que importam em quantidade são o sódio, o potássio, o magnésio e o cálcio, que sobretudo transportam carga e sustentam estruturas; os metais de transição ferro, zinco, cobre, manganês, cobalto, molibdênio e níquel ocorrem em traços, mas comandam boa parte da química. Uma proteína escolhe seu metal pelos átomos doadores que oferece e por sua geometria.

Definição 24.2 (Ácidos duros e moles)

Um ácido duro é um ácido de Lewis pequeno, muito carregado, pouco polarizável (HX+\ce{H+}, MgX2+\ce{Mg^2+}, CaX2+\ce{Ca^2+}, FeX3+\ce{Fe^3+}); um ácido mole é um ácido grande, polarizável e de carga baixa (CuX+\ce{Cu+}, AgX+\ce{Ag+}, HgX2+\ce{Hg^2+}, CdX2+\ce{Cd^2+}). O princípio dos ácidos e bases duros e moles afirma que os ácidos duros se ligam preferencialmente às bases duras (doadores de oxigênio, fluoreto) e os ácidos moles às bases moles (doadores de enxofre, iodeto).

Nas proteínas, os carboxilatos e os fenolatos são duros, o tiolato da cisteína e o tioéter da metionina, moles, e o imidazol da histidina, intermediário. O ferro(III) fica entre doadores de oxigênio, o cobre(I) entre doadores de enxofre, o zinco, um ácido intermediário, com histidina e cisteína; o mercúrio e o cádmio são tóxicos em parte porque capturam as cisteínas das enzimas.

Definição 24.3 (Série de Irving–Williams)

A série de Irving–Williams é a ordem de estabilidade dos complexos de spin alto dos íons divalentes da primeira série de transição com um dado ligante: MnX2+<FeX2+<CoX2+<NiX2+<CuX2+>ZnX2+\ce{Mn^2+} < \ce{Fe^2+} < \ce{Co^2+} < \ce{Ni^2+} < \ce{Cu^2+} > \ce{Zn^2+}.

Proposição 24.4 (Ordem de Irving–Williams)

A série vale para quase todos os ligantes (uma observação experimental); ela acompanha a diminuição do raio iônico do manganês ao cobre, a energia de estabilização do campo ligante, nula para d5d^5, máxima para d8d^8, e a distorção de Jahn–Teller do cobre(II), que encurta quatro de suas ligações.

Argumento. O raio diminui ao longo da série à medida que a carga nuclear cresce, o que reforça a atração eletrostática de todo ligante. A estabilização do campo ligante dos íons octaédricos de spin alto (Capítulo 18) é 00, 44, 88, 1212 e 6 Dq6\,\mathrm{Dq} de d5d^5 a d9d^9, e 00 para d10d^{10}: ela reforça a tendência até o níquel e cai para o zinco; o cobre(II) recupera mais do que sua estabilização sugere por sua distorção tetragonal, que dá quatro ligações curtas e fortes. ∎

Uma consequência que as células precisam gerenciar: o cobre e o zinco desbancariam os outros íons na maioria dos sítios, de modo que suas concentrações livres são mantidas extremamente baixas por proteínas transportadoras dedicadas.

24.2 O transporte de oxigênio

Definição 24.5 (Porfirinas e heme)

Uma porfirina é um macrociclo aromático grande e plano de quatro anéis pirrol unidos por pontes metino, cujos quatro nitrogênios ligam um íon metálico em seu centro. O heme é o complexo de ferro da protoporfirina IX, o cofator da hemoglobina, da mioglobina e dos citocromos.

Na mioglobina e na hemoglobina, o ferro do heme tem um quinto ligante abaixo do anel, o nitrogênio da histidina proximal, e um sexto sítio livre para o OX2\ce{O2}. O ferro(II) desóxi é de spin alto: um elétron no orbital dx2−y2d_{x^2-y^2}, que aponta para os quatro nitrogênios, o torna grande demais para o buraco do anel, e ele fica fora do plano, do lado da histidina. Ao ligar o OX2\ce{O2}, ele passa a spin baixo, menor, e entra no plano, puxando consigo a histidina e a hélice da proteína.

O ferro do heme visto de perfil, com seu deslocamento em relação ao anel desenhado em escala (1 Å para 1.35 cm; as demais distâncias são esquemáticas). Na desoxi-hemoglobina, o ferro(II) de spin alto fica 0.34\, Å abaixo do plano médio dos quatro nitrogênios pirrólicos, do lado da histidina proximal; na oxi-hemoglobina, ele fica a menos de 0.05\, Å do plano, com o O2 ligado pela extremidade e angular (distâncias calculadas a partir de estruturas cristalinas).
O ferro do heme visto de perfil, com seu deslocamento em relação ao anel desenhado em escala (1 Å para 1.35 cm; as demais distâncias são esquemáticas). Na desoxi-hemoglobina, o ferro(II) de spin alto fica 0.34 A˚0.34\,\text{Å} abaixo do plano médio dos quatro nitrogênios pirrólicos, do lado da histidina proximal; na oxi-hemoglobina, ele fica a menos de 0.05 A˚0.05\,\text{Å} do plano, com o OX2\ce{O2} ligado pela extremidade e angular (distâncias calculadas a partir de estruturas cristalinas).

O dioxigênio ligado é mais bem descrito como superóxido sobre ferro(III), FeXIII−OX2X−\ce{Fe^{III}-O2^-}, do que como OX2\ce{O2} neutro sobre ferro(II): o complexo é diamagnético porque os elétrons desemparelhados dos dois centros se acoplam. A proteína impede a oxidação irreversível a ferro(III) e água, que um heme isolado em água sofre imediatamente.

Definição 24.6 (Ligação cooperativa)

A ligação a uma proteína com vários sítios é uma ligação cooperativa quando a ligação de um ligante aumenta a afinidade dos sítios restantes. O coeficiente de Hill nn é a inclinação do gráfico de Hill, log⁡θ1−θ\log\frac{\theta}{1 - \theta} em função de log⁡p\log p, na meia-saturação (θ\theta é a fração de sítios ocupados).

Proposição 24.7 (Um único sítio)

Para uma proteína com um sítio, P+O2⇌PO2\mathrm{P + O_2 \rightleftharpoons PO_2}, a fração ocupada é θ=p/(p50+p)\theta = p/(p_{50} + p), onde p50p_{50} é a constante de dissociação expressa como pressão.

Demonstração. Kd=[P]p/[PO2]=p50K_d = [\mathrm P]p/[\mathrm{PO_2}] = p_{50}, logo [PO2]=[P]p/p50[\mathrm{PO_2}] = [\mathrm P]p/p_{50}, e θ=[PO2]/([P]+[PO2])=(p/p50)/(1+p/p50)\theta = [\mathrm{PO_2}]/([\mathrm P] + [\mathrm{PO_2}]) = (p/p_{50})/(1 + p/p_{50}). ∎

Teorema 24.8 (Equação de Hill)

Para uma proteína com nn sítios que estão ou todos vazios ou todos ocupados, P+n O2⇌P(O2)n\mathrm{P + n\,O_2 \rightleftharpoons P(O_2)_n},

θ=pnp50n+pn,log⁡θ1−θ=nlog⁡p−nlog⁡p50.\theta = \frac{p^n}{p_{50}^n + p^n}, \qquad \log\frac{\theta}{1 - \theta} = n\log p - n\log p_{50}.

Demonstração. Kd=[P]pn/[P(O2)n]K_d = [\mathrm P]p^n/[\mathrm{P(O_2)_n}]; escreva Kd=p50nK_d = p_{50}^n. A fração de sítios ocupados é a de moléculas na forma ocupada, θ=[P(O2)n]/([P]+[P(O2)n])=(p/p50)n/(1+(p/p50)n)\theta = [\mathrm{P(O_2)_n}]/([\mathrm P] + [\mathrm{P(O_2)_n}]) = (p/p_{50})^n/(1 + (p/p_{50})^n). Então θ/(1−θ)=(p/p50)n\theta/(1 - \theta) = (p/p_{50})^n, e tomando os logaritmos obtém-se a reta de inclinação nn. ∎

A hemoglobina, com quatro sítios, não é totalmente cooperativa: seu coeficiente de Hill fica bem abaixo de 4, em torno de 3, e seu gráfico de Hill tem inclinação 1 nas duas extremidades, onde ela se comporta como uma proteína desóxi ou óxi de sítios independentes. A cooperatividade vem de uma mudança de estrutura quaternária: o movimento do ferro para o plano do primeiro heme a ligar o OX2\ce{O2} é transmitido às outras subunidades.

À esquerda: saturação em oxigênio da mioglobina (verde) e da hemoglobina (vermelho; tracejado: a pH mais baixo) em função da pressão de oxigênio, com os valores do modelo p_50 = 0.37\, kPa (Mb) e 3.5\, kPa (Hb), n = 2.7. Entre os pulmões e os tecidos, a hemoglobina cede um quarto de seu oxigênio, a mioglobina quase nada. À direita: os gráficos de Hill correspondentes, retas neste modelo (o gráfico da hemoglobina real se curva para inclinação 1 nas duas extremidades).
À esquerda: saturação em oxigênio da mioglobina (verde) e da hemoglobina (vermelho; tracejado: a pH mais baixo) em função da pressão de oxigênio, com os valores do modelo p50=0.37 kPap_{50} = 0.37\,\mathrm{kPa} (Mb) e 3.5 kPa3.5\,\mathrm{kPa} (Hb), n=2.7n = 2.7. Entre os pulmões e os tecidos, a hemoglobina cede um quarto de seu oxigênio, a mioglobina quase nada. À direita: os gráficos de Hill correspondentes, retas neste modelo (o gráfico da hemoglobina real se curva para inclinação 1 nas duas extremidades).

Método 24.9 (Ler um gráfico de Hill)

  1. A partir de cada saturação medida, calcule log⁡(θ/(1−θ))\log(\theta/(1 - \theta)); trace-o em função de log⁡p\log p.
  2. A pressão em que o gráfico cruza o zero é p50p_{50}.
  3. A inclinação nesse ponto é o coeficiente de Hill: n=1n = 1 significa sítios independentes, n>1n > 1, ligação cooperativa.
  4. Com apenas dois pontos, n=Δlog⁡(θ/(1−θ))/Δlog⁡pn = \Delta\log(\theta/(1 - \theta))/\Delta\log p.

A hemoglobina também liga prótons e dióxido de carbono em sítios afastados do heme, o que desloca sua curva para a direita onde eles são abundantes, nos tecidos em atividade: o efeito Bohr libera mais oxigênio exatamente onde ele é necessário.

Proposição 24.10 (Competição com o monóxido de carbono)

Se o monóxido de carbono e o dioxigênio competem pelos mesmos sítios, com HbO2+CO⇌HbCO+O2\mathrm{HbO_2 + CO \rightleftharpoons HbCO + O_2} de constante de equilíbrio MM, então [HbCO]/[HbO2]=M p(CO)/p(OX2)[\mathrm{HbCO}]/[\mathrm{HbO_2}] = M\,p(\ce{CO})/p(\ce{O2}).

Demonstração. No equilíbrio, M=[HbCO] p(OX2)/([HbO2] p(CO))M = [\mathrm{HbCO}]\,p(\ce{O2})/([\mathrm{HbO_2}]\,p(\ce{CO})); rearranjando, obtém-se o resultado. ∎

MM é da ordem das centenas para a hemoglobina humana, de modo que algumas centenas de partes por milhão de monóxido de carbono ocupam uma grande fração dos sítios; pior, os sítios que ficam livres retêm seu oxigênio mais firmemente, pois a cooperatividade age sobre eles. O heme livre liga o monóxido de carbono muito mais fortemente ainda: na proteína, uma histidina distal acima do ferro dificulta a geometria linear Fe–C–O que o monóxido de carbono prefere, ao passo que faz ligação de hidrogênio com o OX2\ce{O2} angular. Outros animais usam outros metais: as hemocianinas dos moluscos e dos artrópodes ligam o OX2\ce{O2} entre dois íons cobre na forma de peróxido, as hemeritrinas de alguns vermes marinhos, sobre um par de íons ferro.

No laboratório — Uma curva de ligação do oxigênio

Uma solução de hemoglobina em tampão é colocada em uma cubeta estanque a gases provida de um balão lateral. Ela é primeiro livrada do oxigênio por purga com nitrogênio; depois, volumes conhecidos de ar são injetados e a solução é equilibrada por leve inclinação. Após cada adição, registra-se o espectro visível: as bandas da forma desóxi (uma banda perto de 555 nm555\,\mathrm{nm}) dão lugar às duas bandas da forma óxi, e a saturação é lida pela absorbância em um comprimento de onda, entre seus limites desóxi e óxi.

24.3 Metaloenzimas

A anidrase carbônica acelera COX2+HX2O⇌HCOX3X−+HX+\ce{CO2 + H2O <=> HCO3- + H+}, que em água pura leva segundos, o suficiente para importar na curta passagem da hemácia por um capilar pulmonar. Seu íon zinco é mantido por três histidinas e uma molécula de água. Cátion pequeno e de carga alta, ele abaixa o pKa\mathrm pK_a dessa água de cerca de 14 para cerca de 7: em pH fisiológico, boa parte da enzima carrega um hidróxido ligado ao zinco, um nucleófilo forte, mantido bem ao lado de uma cavidade que liga o COX2\ce{CO2}.

O ciclo catalítico da anidrase carbônica. A água ligada ao zinco perde um próton; o hidróxido ligado ao zinco ataca o dióxido de carbono; a água desloca o hidrogenocarbonato. A transferência de próton para o solvente é a etapa mais lenta.
O ciclo catalítico da anidrase carbônica. A água ligada ao zinco perde um próton; o hidróxido ligado ao zinco ataca o dióxido de carbono; a água desloca o hidrogenocarbonato. A transferência de próton para o solvente é a etapa mais lenta.

Proposição 24.11 (Uma enzima rápida)

A constante de especificidade kcat/KMk_{\mathrm{cat}}/K_M da anidrase carbônica se aproxima da constante de velocidade de encontro do COX2\ce{CO2} com a enzima: quase todo encontro leva à reação.

Argumento. kcat/KMk_{\mathrm{cat}}/K_M é a constante de velocidade de segunda ordem da enzima com o substrato a baixa concentração de substrato (Capítulo 13); ela não pode exceder a constante de velocidade, controlada por difusão, de seu encontro (Capítulo 12). Os valores medidos para a anidrase carbônica estão entre os mais altos conhecidos para qualquer enzima e se aproximam desse limite: a química dentro do sítio ativo deixa então de ser o que limita a velocidade. ∎

As enzimas do citocromo P450, no fígado e em muitas outras células, hidroxilam ligações C–H de fármacos e hormônios. Seu ferro hemínico é mantido por um tiolato de cisteína; com OX2\ce{O2} e dois elétrons, ele forma um complexo ferro(IV)-oxo com um radical na porfirina, chamado composto I, que abstrai um átomo de hidrogênio do substrato e devolve o grupo hidroxila ao radical carbonado. A nitrogenase reduz o NX2\ce{N2} a amônia à temperatura ambiente em um agregado de sete átomos de ferro, um de molibdênio e nove sulfetos em torno de um átomo de carbono central, o cofator FeMo, ao custo de muitas moléculas de ATP. A vitamina B12\mathrm{B_{12}} contém uma ligação cobalto–carbono, uma das pouquíssimas ligações metal–carbono da biologia, cuja homólise inicia rearranjos radicalares.

24.4 Transferência de elétrons e energia

As proteínas que apenas transportam elétrons têm centros metálicos com pequenas energias de reorganização (Capítulo 19): os dois estados de oxidação têm quase a mesma geometria, de modo que a barreira de Marcus é baixa.

Definição 24.12 (Centros ferro–enxofre)

Um centro ferro–enxofre é um grupo de íons ferro unidos em ponte por íons sulfeto e ligados à proteína por tiolatos de cisteína: [2 Fe-2 S]\ce{[2Fe-2S]}, [3 Fe-4 S]\ce{[3Fe-4S]} e o [4 Fe-4 S]\ce{[4Fe-4S]}, de tipo cubano.

Definição 24.13 (Proteínas de cobre azul)

Uma proteína de cobre azul contém um íon cobre ligado a duas histidinas, a uma cisteína e a uma metionina fracamente ligada em um sítio tetraédrico distorcido; sua intensa cor azul vem de uma banda de transferência de carga cisteína–cobre(II).

Definição 24.14 (Estado entático)

O estado entático é um sítio metálico mantido pela proteína em uma geometria tensionada, intermediária entre as geometrias preferidas por seus dois estados de oxidação, o que abaixa a energia de reorganização de suas reações.

O cobre(II) sozinho prefere um quadrado plano, o cobre(I) um tetraedro: no sítio de cobre azul, nenhum dos dois é satisfeito, e a transferência de elétrons é rápida.

Definição 24.15 (Complexo de evolução de oxigênio)

O complexo de evolução de oxigênio do fotossistema II é o agregado Mn4CaO5\mathrm{Mn_4CaO_5} que oxida a água a dioxigênio na fotossíntese.

Proposição 24.16 (Quatro fótons por oxigênio)

Oxidar duas moléculas de água a um OX2\ce{O2} exige quatro fótons absorvidos pelo fotossistema II, passando o agregado por cinco estados, de S0\mathrm S_0 a S4\mathrm S_4.

Demonstração. 2 HX2O→OX2+4 HX++4 eX−\ce{2H2O -> O2 + 4H+ + 4e-}: quatro elétrons precisam ser retirados. Cada fóton absorvido pelo centro de reação afasta dele um elétron, e o agregado repõe o centro oxidado um elétron por vez: quatro fótons, quatro etapas, armazenando equivalentes oxidantes nos estados S1\mathrm S_1 a S4\mathrm S_4; S4\mathrm S_4 libera o OX2\ce{O2} e volta a S0\mathrm S_0. ∎

O ciclo de Kok do complexo de evolução de oxigênio. Cada fóton absorvido pelo fotossistema II retira um elétron do agregado de manganês (os prótons saem no caminho); a quarta oxidação dá S_4, que libera o dioxigênio e volta a ligar duas moléculas de água.
O ciclo de Kok do complexo de evolução de oxigênio. Cada fóton absorvido pelo fotossistema II retira um elétron do agregado de manganês (os prótons saem no caminho); a quarta oxidação dá S4\mathrm S_4, que libera o dioxigênio e volta a ligar duas moléculas de água.

Na outra ponta da cadeia energética, a citocromo cc oxidase das mitocôndrias reduz o OX2\ce{O2} a água com quatro elétrons e quatro prótons em um ferro hemínico e um íon cobre frente a frente, sem liberar o superóxido ou o peróxido, parcialmente reduzidos e nocivos.

24.5 Os metais na medicina

Definição 24.17 (Metalofármacos)

Um metalofármaco é um fármaco cuja atividade depende de um íon metálico ou de um complexo metálico.

A cisplatina, cis-[PtClX2(NHX3)X2]\ce{[PtCl2(NH3)2]}, é estável no sangue, onde a concentração de cloreto é alta; dentro das células, onde ela é muito menor, troca um cloreto por água (Capítulo 19). O aquacomplexo se liga ao átomo N7 de uma guanina, depois a uma segunda guanina vizinha na mesma fita: a ligação cruzada 1,2-GG dobra o DNA, que a célula não consegue reparar, e ela morre. O isômero trans não consegue fazer ponte entre duas bases vizinhas e é inativo. A carboplatina, com um dicarboxilato quelante que sai lentamente, tem menos efeitos colaterais; a oxaliplatina, com um ligante diaminociclo-hexano, age sobre tumores resistentes à cisplatina.

A ligação cruzada intrafita 1,2 formada pela cisplatina, esquemática: depois de perder seus dois cloretos, a platina se liga aos átomos N7 de duas guaninas adjacentes de uma mesma fita, conservando seus dois ligantes amin cis. O aduto real dobra a dupla hélice.
A ligação cruzada intrafita 1,2 formada pela cisplatina, esquemática: depois de perder seus dois cloretos, a platina se liga aos átomos N7 de duas guaninas adjacentes de uma mesma fita, conservando seus dois ligantes amin cis. O aduto real dobra a dupla hélice.

Definição 24.18 (Agentes de contraste)

Um agente de contraste para a imagem por ressonância magnética é um composto paramagnético que encurta os tempos de relaxação dos prótons da água próximos. Sua relaxividade r1r_1 é o aumento da velocidade de relaxação 1/T11/T_1 por unidade de concentração do agente.

Proposição 24.19 (Velocidade de relaxação)

Com um agente de relaxividade r1r_1 na concentração cc, a velocidade de relaxação dos prótons da água é 1/T1=1/T1,0+r1c1/T_1 = 1/T_{1,0} + r_1c, onde T1,0T_{1,0} é o valor sem agente.

Demonstração. A contribuição paramagnética é proporcional ao número de moléculas de agente que as moléculas de água visitam por unidade de tempo, logo a cc; as velocidades de relaxação de mecanismos independentes se somam. Pela definição de r1r_1, a velocidade acrescentada é r1cr_1c. ∎

O gadolínio(III), 4f74f^7, com sete elétrons desemparelhados e um spin eletrônico de relaxação lenta, é o metal preferido. O GdX3+\ce{Gd^3+} livre é tóxico: ele é administrado como um complexo muito estável de um poliaminocarboxilato octadentado que deixa um sítio para uma molécula de água, que se troca rapidamente com a água livre e transmite a relaxação a toda ela.

Definição 24.20 (Terapia de quelação)

A terapia de quelação é a remoção de um metal tóxico do organismo por um ligante quelante administrado como fármaco, que forma um complexo estável e solúvel que é excretado.

Método 24.21 (Escolher um fármaco quelante)

  1. Compare as constantes de estabilidade do quelante com o metal tóxico e com os metais essenciais presentes em grande quantidade (CaX2+\ce{Ca^2+}, MgX2+\ce{Mg^2+}, ZnX2+\ce{Zn^2+}).
  2. Calcule o nível de metal livre pM=−log⁡[M]\mathrm{pM} = -\log[\mathrm M] que o quelante deixa nas concentrações e no pH do organismo: quanto mais alto o pM do metal tóxico e mais baixo o dos essenciais, melhor.
  3. Administre o quelante já carregado com o íon essencial competidor (o complexo de cálcio do EDTA para o chumbo), de modo que ele troque, em vez de retirar, o cálcio do sangue.
  4. Verifique a correspondência duro–mole (doadores de enxofre para o mercúrio e o chumbo, doadores de oxigênio duros para o ferro(III)) e que o complexo é excretado.

Segurança

Cisplatina: fatal se ingerida, pode provocar câncer e defeitos genéticos, pode prejudicar a fertilidade, provoca lesões oculares graves e reações alérgicas; é manipulada apenas como solução de fármaco já preparada, com luvas, em cabine ventilada.

História — Uma estrutura de proteína e um fármaco acidental

Max Perutz trabalhou por mais de vinte anos na estrutura por raios X da hemoglobina, resolvida em baixa resolução em 1959; com John Kendrew, que resolveu a da mioglobina, recebeu o Prêmio Nobel de Química de 1962. Em 1965, Barnett Rosenberg, passando uma corrente entre eletrodos de platina em uma cultura de bactérias, viu-as crescer em longos filamentos sem se dividir; a causa não era a corrente, mas um complexo amin de platina formado a partir dos eletrodos. Ele se tornou a cisplatina, ainda hoje um dos fármacos anticâncer mais usados.

24.6 Exercícios

Exercício 24.1 ★

Uma proteína está 20 % saturada a 2.1 kPa2.1\,\mathrm{kPa} de oxigênio e 80 % a 5.9 kPa5.9\,\mathrm{kPa}. Calcule seu coeficiente de Hill.

Solução

Solução de Exercício 24.1.

log⁡(θ/(1−θ))\log(\theta/(1 - \theta)) vai de log⁡0.25=−0.602\log 0.25 = -0.602 a log⁡4=+0.602\log 4 = +0.602 enquanto log⁡p\log p aumenta log⁡(5.9/2.1)=0.449\log(5.9/2.1) = 0.449: n=1.204/0.449=2.7n = 1.204/0.449 = 2.7.

Exercício 24.2 ★

Ordene ZnX2+\ce{Zn^2+}, MnX2+\ce{Mn^2+}, CuX2+\ce{Cu^2+}, FeX2+\ce{Fe^2+}, NiX2+\ce{Ni^2+} e CoX2+\ce{Co^2+} pela estabilidade de seus complexos com um dado ligante e explique o lugar do zinco.

Solução

Solução de Exercício 24.2.

MnX2+<FeX2+<CoX2+<NiX2+<CuX2+>ZnX2+\ce{Mn^2+} < \ce{Fe^2+} < \ce{Co^2+} < \ce{Ni^2+} < \ce{Cu^2+} > \ce{Zn^2+}. O zinco (d10d^{10}) não tem estabilização do campo ligante nem distorção de Jahn–Teller: ele volta a ficar abaixo do cobre.

Exercício 24.3 ★

Preveja os doadores proteicos preferidos (carboxilato, tiolato de cisteína, imidazol de histidina) de CaX2+\ce{Ca^2+}, FeX3+\ce{Fe^3+}, CuX+\ce{Cu+}, ZnX2+\ce{Zn^2+} e HgX2+\ce{Hg^2+}.

Solução

Solução de Exercício 24.3.

CaX2+\ce{Ca^2+} e FeX3+\ce{Fe^3+}, duros: carboxilatos (e fenolatos para o ferro). CuX+\ce{Cu+} e HgX2+\ce{Hg^2+}, moles: tiolatos de cisteína. ZnX2+\ce{Zn^2+}, intermediário: histidina e cisteína.

Exercício 24.4 ★

Quantos elétrons são retirados e quantos fótons absorvidos pelo fotossistema II por molécula de OX2\ce{O2} liberada? Por mol?

Solução

Solução de Exercício 24.4.

2 HX2O→OX2+4 HX++4 eX−\ce{2H2O -> O2 + 4H+ + 4e-}: quatro elétrons, quatro fótons por OX2\ce{O2}; quatro mols de fótons por mol de OX2\ce{O2}.

Exercício 24.5 ★★

Com as curvas-modelo do capítulo (p50=0.37 kPap_{50} = 0.37\,\mathrm{kPa} para a mioglobina; 3.5 kPa3.5\,\mathrm{kPa} e n=2.7n = 2.7 para a hemoglobina), calcule a fração de seu oxigênio que cada proteína cede entre 13 kPa13\,\mathrm{kPa} (pulmões) e 5 kPa5\,\mathrm{kPa} (tecidos).

Solução

Solução de Exercício 24.5.

Mioglobina: θ=13/13.37=0.972\theta = 13/13.37 = 0.972 e 5/5.37=0.9315/5.37 = 0.931: ela cede (0.972−0.931)/0.972=4(0.972 - 0.931)/0.972 = 4 % de seu oxigênio. Hemoglobina: θ=0.972\theta = 0.972 e 0.7240.724: ela cede 26 %.

Exercício 24.6 ★★

Ar contendo 50 ppm50\,\mathrm{ppm} de monóxido de carbono é respirado por tempo suficiente para atingir o equilíbrio. Com M=230M = 230 (dados do exercício) e p(OX2)/p(CO)p(\ce{O2})/p(\ce{CO}) igual à do ar (20.95 % de oxigênio), que fração da hemoglobina carrega CO?

Solução

Solução de Exercício 24.6.

[HbCO]/[HbO2]=230×50×10−6/0.2095=0.055[\mathrm{HbCO}]/[\mathrm{HbO_2}] = 230 \times 50 \times 10^{-6}/0.2095 = 0.055; fração 0.055/1.055=5.20.055/1.055 = 5.2 %.

Exercício 24.7 ★★

Dê os estados de oxidação formais dos íons ferro nos agregados [FeX2SX2(SR)X4]X2−\ce{[Fe2S2(SR)4]^2-}, [FeX2SX2(SR)X4]X3−\ce{[Fe2S2(SR)4]^3-} e [FeX4SX4(SR)X4]X2−\ce{[Fe4S4(SR)4]^2-} (SR: cisteinato, S: sulfeto).

Solução

Solução de Exercício 24.7.

Sulfetos −2-2 cada, cisteinatos −1-1 cada. [FeX2SX2(SR)X4]X2−\ce{[Fe2S2(SR)4]^2-}: soma dos ferros −2+4+4=+6-2 + 4 + 4 = +6: dois Fe(III). [FeX2SX2(SR)X4]X3−\ce{[Fe2S2(SR)4]^3-}: +5+5, um Fe(III) e um Fe(II) (valência mista). [FeX4SX4(SR)X4]X2−\ce{[Fe4S4(SR)4]^2-}: −2+8+4=+10-2 + 8 + 4 = +10, dois Fe(III) e dois Fe(II), cada ferro +2.5+2.5 em média.

Exercício 24.8 ★★

Escreva a primeira aquação da cisplatina e explique por que ela é lenta no sangue e mais rápida dentro das células. A que átomo do DNA a platina se liga, e por que o isômero trans é inativo?

Solução

Solução de Exercício 24.8.

[PtClX2(NHX3)X2]+HX2O→[PtCl(HX2O)(NHX3)X2]X++ClX−\ce{[PtCl2(NH3)2] + H2O -> [PtCl(H2O)(NH3)2]+ + Cl-}. A alta concentração de cloreto do sangue desloca o equilíbrio de volta; dentro das células, o cloreto é muito menor, e o aquacomplexo se forma. A platina se liga ao N7 da guanina. No isômero trans, os dois sítios lábeis são opostos e não conseguem alcançar duas bases adjacentes de uma mesma fita.

Exercício 24.9 ★★

Um tecido tem T1=1.2 sT_1 = 1.2\,\mathrm{s}. Um agente de gadolínio de relaxividade 4.0 L mmol−1 s−14.0\,\mathrm{L}\,\mathrm{mmol}^{-1}\,\mathrm{s}^{-1} atinge 0.10 mmol/L0.10\,\mathrm{mmol}/\mathrm{L} nele (dados do exercício). Calcule o novo T1T_1.

Solução

Solução de Exercício 24.9.

1/T1=1/1.2 s+4.0 L mmol−1 s−1×0.10 mmol/L=0.833+0.400=1.23 s−11/T_1 = 1/1.2\,\mathrm{s} + 4.0\,\mathrm{L}\,\mathrm{mmol}^{-1}\,\mathrm{s}^{-1} \times 0.10\,\mathrm{mmol}/\mathrm{L} = 0.833 + 0.400 = 1.23\,\mathrm{s}^{-1}: T1=0.81 sT_1 = 0.81\,\mathrm{s}.

Exercício 24.10 ★★★

Um quelante L tem log⁡K=18.0\log K = 18.0 com PbX2+\ce{Pb^2+} e 10.710.7 com CaX2+\ce{Ca^2+} (dados do exercício). Calcule a constante de equilíbrio de PbX2++[CaL]X2−⇌[PbL]X2−+CaX2+\ce{Pb^2+ + [CaL]^2- <=> [PbL]^2- + Ca^2+} e explique por que se administra o complexo de cálcio e não o ligante livre.

Solução

Solução de Exercício 24.10.

K=KPbL/KCaL=1018.0−10.7=107.3=2×107K = K_{\mathrm{PbL}}/K_{\mathrm{CaL}} = 10^{18.0 - 10.7} = 10^{7.3} = 2 \times 10^{7}: o chumbo desloca completamente o cálcio. O ligante livre ligaria também o cálcio do sangue e abaixaria perigosamente sua concentração; o complexo de cálcio troca com o chumbo e deixa inalterado o nível de cálcio.

Exercício 24.11 ★★★

A anidrase carbônica tem kcat/KM≈1×108 L mol−1 s−1k_{\mathrm{cat}}/K_M \approx 1 \times 10^{8}\,\mathrm{L}\,\mathrm{mol}^{-1}\,\mathrm{s}^{-1} (dados do exercício); uma enzima típica, cerca de 1×105 L mol−1 s−11 \times 10^{5}\,\mathrm{L}\,\mathrm{mol}^{-1}\,\mathrm{s}^{-1}. Com [COX2]=1.0 mmol/L[\ce{CO2}] = 1.0\,\mathrm{mmol}/\mathrm{L}, muito abaixo de KMK_M, compare o tempo que cada uma leva para converter metade do substrato com uma concentração de enzima de 1.0 µmol/L1.0\,\text{µ}\mathrm{mol}/\mathrm{L}.

Solução

Solução de Exercício 24.11.

Muito abaixo de KMK_M, a reação é de primeira ordem: k′=(kcat/KM)[E]k' = (k_{\mathrm{cat}}/K_M)[\mathrm E], t1/2=ln⁡2/k′t_{1/2} = \ln 2/k'. Anidrase carbônica: k′=100 s−1k' = 100\,\mathrm{s}^{-1}, t1/2=6.9 mst_{1/2} = 6.9\,\mathrm{ms}. Enzima típica: k′=0.10 s−1k' = 0.10\,\mathrm{s}^{-1}, t1/2=6.9 st_{1/2} = 6.9\,\mathrm{s}, mil vezes mais, lento demais para o segundo que uma hemácia passa em um capilar pulmonar.

Exercício 24.12 ★★★

Com M=230M = 230, que pressão de monóxido de carbono ocupa metade dos sítios na presença de ar a 0.2095 bar0.2095\,\mathrm{bar} de oxigênio? Exprima-a em ppm de um gás a 1 bar1\,\mathrm{bar}.

Solução

Solução de Exercício 24.12.

Metade dos sítios com CO significa [HbCO]=[HbO2][\mathrm{HbCO}] = [\mathrm{HbO_2}]: p(CO)=p(OX2)/M=0.2095/230=9.1×10−4 barp(\ce{CO}) = p(\ce{O2})/M = 0.2095/230 = 9.1 \times 10^{-4}\,\mathrm{bar}, cerca de 910 ppm910\,\mathrm{ppm}.

24.7 Problema: Quanto oxigênio o sangue fornece?

Problema 24.1

Problema de fim de semana — quanto oxigênio o sangue fornece? Curvas de Hill da hemoglobina e da mioglobina, o oxigênio transportado por um litro de sangue, o deslocamento de Bohr e o que o monóxido de carbono tira

Dados-modelo do problema: hemoglobina p50=3.5 kPap_{50} = 3.5\,\mathrm{kPa} e n=2.7n = 2.7 a pH 7.4, p50=4.0 kPap_{50} = 4.0\,\mathrm{kPa} ao pH mais baixo dos tecidos em atividade; mioglobina p50=0.37 kPap_{50} = 0.37\,\mathrm{kPa}; o sangue contém 150 g/L150\,\mathrm{g}/\mathrm{L} de hemoglobina, de massa molar 64.5 kg/mol64.5\,\mathrm{kg}/\mathrm{mol}, com quatro sítios por molécula; p(OX2)p(\ce{O2}) é de 13 kPa13\,\mathrm{kPa} nos pulmões e de 5.0 kPa5.0\,\mathrm{kPa} nos tecidos; o coração bombeia 5.0 L/min5.0\,\mathrm{L}/\mathrm{min} em repouso; M=230M = 230 para o monóxido de carbono. Volumes de gás a 273.15 K273.15\,\mathrm{K} e 101.325 kPa101.325\,\mathrm{kPa}.

Parte I — As curvas.

  1. Calcule a saturação da hemoglobina nos pulmões.
  2. Calcule-a nos tecidos a pH 7.4.
  3. Calcule a saturação da mioglobina a 5.0 kPa5.0\,\mathrm{kPa}.
  4. Por que a mioglobina pode tomar o oxigênio da hemoglobina em um músculo?
  5. Que coeficiente de Hill quatro sítios independentes dariam?
  6. Explique em uma frase de onde vem a cooperatividade.

Parte II — Um litro de sangue.

  1. Calcule a concentração de hemoglobina em mol/L.
  2. Calcule a concentração de sítios de oxigênio.
  3. Calcule o oxigênio transportado por litro nos pulmões, em mmol.
  4. Calcule o oxigênio fornecido por litro aos tecidos a pH 7.4.
  5. Converta-o em mililitros de gás.
  6. Que fração do oxigênio transportado isso representa?

Parte III — O deslocamento de Bohr.

  1. Calcule a saturação nos tecidos ao pH mais baixo.
  2. Calcule o oxigênio fornecido por litro com o deslocamento.
  3. Por que fator o deslocamento aumenta o fornecimento?
  4. O que abaixa o pH de um músculo em atividade?
  5. Calcule o oxigênio fornecido por minuto em repouso, em mmol.
  6. Converta-o em litros de gás por minuto.

Parte IV — O monóxido de carbono.

  1. Calcule [HbCO]/[HbO2][\mathrm{HbCO}]/[\mathrm{HbO_2}] para ar com 100 ppm100\,\mathrm{ppm} de CO.
  2. Calcule a fração de sítios perdida para o CO.
  3. Por que a perda de oxigênio fornecido é pior que essa fração?
  4. Por que o oxigênio puro é o primeiro tratamento?
  5. Por que a histidina distal importa para a sobrevivência?
  6. Enuncie o resultado: os litros de oxigênio fornecidos por minuto em repouso.
Solução

Solução de Problema 24.1.

1. θ=132.7/(3.52.7+132.7)=0.972\theta = 13^{2.7}/(3.5^{2.7} + 13^{2.7}) = 0.972.

2. θ(5.0 kPa)=0.724\theta(5.0\,\mathrm{kPa}) = 0.724.

3. 5.0/(0.37+5.0)=0.9315.0/(0.37 + 5.0) = 0.931.

4. Seu p50p_{50} é dez vezes menor: às pressões de um músculo em atividade, ela está muito mais saturada que a hemoglobina à mesma pressão, de modo que o oxigênio passa da hemoglobina para a mioglobina.

5. n=1n = 1.

6. A ligação a um heme leva seu ferro para o plano e puxa a histidina e sua hélice; as subunidades passam juntas para uma forma de maior afinidade nos outros sítios.

7. 150 g/L/64 500 g/mol=2.33×10−3 mol/L150\,\mathrm{g}/\mathrm{L}/64\,500\,\mathrm{g}/\mathrm{mol} = 2.33 \times 10^{-3}\,\mathrm{mol}/\mathrm{L}.

8. 4×2.33×10−3=9.30×10−3 mol/L4 \times 2.33 \times 10^{-3} = 9.30 \times 10^{-3}\,\mathrm{mol}/\mathrm{L}.

9. 9.30 mmol/L×0.972=9.04 mmol9.30\,\mathrm{mmol}/\mathrm{L} \times 0.972 = 9.04\,\mathrm{mmol}.

10. 9.30 mmol/L×(0.972−0.724)=2.31 mmol9.30\,\mathrm{mmol}/\mathrm{L} \times (0.972 - 0.724) = 2.31\,\mathrm{mmol}.

11. 2.31×10−3 mol×22.41 L/mol=52 mL2.31 \times 10^{-3}\,\mathrm{mol} \times 22.41\,\mathrm{L}/\mathrm{mol} = 52\,\mathrm{mL}.

12. 0.248/0.972=260.248/0.972 = 26 %.

13. 5.02.7/(4.02.7+5.02.7)=0.6465.0^{2.7}/(4.0^{2.7} + 5.0^{2.7}) = 0.646.

14. 9.30 mmol/L×(0.972−0.646)=3.03 mmol9.30\,\mathrm{mmol}/\mathrm{L} \times (0.972 - 0.646) = 3.03\,\mathrm{mmol}.

15. 3.03/2.31=1.313.03/2.31 = 1.31: trinta por cento a mais.

16. O dióxido de carbono produzido pela respiração, hidratado a ácido carbônico pela anidrase carbônica, e o ácido lático no esforço intenso.

17. 3.03 mmol/L×5.0 L/min=15.1 mmol/min3.03\,\mathrm{mmol}/\mathrm{L} \times 5.0\,\mathrm{L}/\mathrm{min} = 15.1\,\mathrm{mmol}/\mathrm{min}.

18. 15.1×10−3 mol/min×22.41 L/mol=0.34 L/min15.1 \times 10^{-3}\,\mathrm{mol}/\mathrm{min} \times 22.41\,\mathrm{L}/\mathrm{mol} = 0.34\,\mathrm{L}/\mathrm{min}.

19. 230×100×10−6/0.2095=0.110230 \times 100 \times 10^{-6}/0.2095 = 0.110.

20. 0.110/1.110=0.0990.110/1.110 = 0.099: cerca de 10 % dos sítios.

21. Os sítios que ainda carregam oxigênio, em uma molécula que também carrega CO, estão na forma de alta afinidade: a curva se desloca para a esquerda e eles liberam menos de seu oxigênio nos tecidos.

22. Pela relação de competição, a razão [HbCO]/[HbO2][\mathrm{HbCO}]/[\mathrm{HbO_2}] cai em proporção a p(OX2)p(\ce{O2}): respirar oxigênio puro, quase cinco vezes a pressão no ar, desloca o monóxido de carbono mais depressa.

23. Ao dificultar a ligação linear do CO e fazer ligação de hidrogênio com o OX2\ce{O2}, ela mantém MM na casa das centenas, em vez do valor muito maior do heme livre; caso contrário, mesmo o monóxido de carbono produzido no organismo bloquearia boa parte da hemoglobina.

24. Em repouso, o sangue fornece cerca de 0.34 L0.34\,\mathrm{L} de oxigênio por minuto.

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